ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Issoria lathonia mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018030	TTTAT	3	126	140	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_018030	ATT	4	490	501	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122381
3	NC_018030	ATT	4	533	545	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122381
4	NC_018030	AATT	3	787	797	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122381
5	NC_018030	TATT	3	853	863	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122381
6	NC_018030	ATTT	3	866	877	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122381
7	NC_018030	ATTA	4	1027	1041	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	39122381
8	NC_018030	TTTA	3	1102	1113	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122381
9	NC_018030	T	14	1249	1262	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	39122381
10	NC_018030	TAT	4	2027	2038	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122381
11	NC_018030	GAAA	3	2237	2248	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39122381
12	NC_018030	ATTT	4	2478	2493	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122381
13	NC_018030	AATTAT	3	2844	2861	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	39122381
14	NC_018030	ATT	4	2890	2900	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122381
15	NC_018030	CATTA	3	3334	3347	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	39122381
16	NC_018030	AATT	3	3719	3729	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122381
17	NC_018030	ATT	4	3845	3856	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_018030	ATT	4	3949	3959	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122381
19	NC_018030	ATA	5	4003	4017	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122381
20	NC_018030	TATTT	4	4257	4276	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	39122381
21	NC_018030	TCATTA	3	4346	4363	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	39122381
22	NC_018030	T	13	4979	4991	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	39122381
23	NC_018030	ATT	4	5110	5121	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122381
24	NC_018030	TAAA	3	6353	6364	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39122381
25	NC_018030	ATT	4	6757	6768	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122381
26	NC_018030	TAT	4	7263	7274	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122381
27	NC_018030	TAA	4	7287	7298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122381
28	NC_018030	TAAA	3	7521	7531	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122381
29	NC_018030	TAA	4	7721	7733	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122381
30	NC_018030	TAAA	3	7761	7772	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39122381
31	NC_018030	AAAAAT	3	7993	8010	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	39122381
32	NC_018030	A	15	9098	9112	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	39122381
33	NC_018030	AATAA	4	9159	9178	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	39122381
34	NC_018030	TAT	4	9350	9361	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122381
35	NC_018030	TAAAT	3	9454	9468	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	39122381
36	NC_018030	AT	7	9566	9580	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	39122381
37	NC_018030	ATT	4	9582	9594	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122381
38	NC_018030	A	12	9610	9621	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	39122381
39	NC_018030	AAT	4	9703	9713	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122381
40	NC_018030	ATT	5	9841	9855	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_018030	ATTTT	4	10016	10035	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	39122382
42	NC_018030	ATT	5	10052	10066	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39122382
43	NC_018030	TAT	5	10151	10165	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39122382
44	NC_018030	AAAT	3	10216	10226	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122382
45	NC_018030	TAA	7	10306	10326	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	39122382
46	NC_018030	TTTA	4	10323	10338	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122382
47	NC_018030	TA	6	10580	10590	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122382
48	NC_018030	T	14	10688	10701	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	39122382
49	NC_018030	TTA	7	10774	10793	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	39122382
50	NC_018030	ATTT	3	10982	10992	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122382
51	NC_018030	ATTT	3	11011	11021	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122382
52	NC_018030	ATTTTA	4	11124	11147	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	39122382
53	NC_018030	AATTTT	3	11315	11332	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39122382
54	NC_018030	TAT	4	11417	11427	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122382
55	NC_018030	AAAT	3	11674	11684	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122382
56	NC_018030	A	12	11773	11784	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	39122382
57	NC_018030	TAT	4	12571	12582	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122382
58	NC_018030	TA	6	12598	12608	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_018030	AAT	4	12645	12656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_018030	TTTAAT	3	12822	12839	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_018030	T	14	12860	12873	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_018030	ATA	4	13010	13021	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_018030	ATTTTA	3	13022	13040	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_018030	TAT	4	13055	13066	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_018030	AATTTA	3	13343	13360	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_018030	TATTTT	3	13394	13411	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_018030	ATT	5	13531	13545	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_018030	TTA	4	13761	13773	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_018030	ATTT	3	13887	13897	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_018030	TATAT	3	14585	14598	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_018030	TAATT	3	14606	14620	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018030	TAAT	5	14711	14730	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_018030	T	22	14837	14858	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_018030	AAT	4	14986	14998	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_018030	AT	6	15008	15018	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_018030	AAAT	4	15019	15034	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_018030	AT	12	15048	15070	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_018030	AT	18	15084	15117	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Issoria lathonia mitochondrion