ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Huperzia squarrosa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017755	TA	6	23901	23911	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509973
2	NC_017755	GA	6	38887	38898	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_017755	TA	6	42465	42475	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_017755	GA	6	42480	42491	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_017755	TA	7	47438	47450	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_017755	TC	6	52906	52918	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38509973
7	NC_017755	AG	6	60523	60533	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_017755	AT	6	60868	60880	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_017755	TA	6	61450	61460	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_017755	AG	6	85035	85045	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_017755	TA	6	97330	97340	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509974
12	NC_017755	TA	6	106200	106210	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509974
13	NC_017755	AT	6	118535	118546	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_017755	AT	6	133804	133815	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509974
15	NC_017755	AC	6	138439	138449	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	38509974
16	NC_017755	TG	6	151999	152010	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_017755	TA	6	155618	155628	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_017755	TA	6	162239	162249	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509974
19	NC_017755	TG	6	167538	167548	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_017755	CG	6	169617	169627	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
21	NC_017755	TA	6	180038	180048	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509974
22	NC_017755	GA	6	186469	186479	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38509980
23	NC_017755	AG	6	189736	189747	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_017755	TA	9	204191	204207	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_017755	AT	6	208306	208316	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_017755	CA	6	216608	216618	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_017755	TA	6	219213	219223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509974
28	NC_017755	GA	6	221272	221282	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38509981
29	NC_017755	GA	6	246746	246757	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_017755	AT	19	249487	249522	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_017755	GT	6	249942	249953	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_017755	TA	6	254608	254618	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_017755	TA	6	258194	258205	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_017755	TA	7	264445	264459	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38509975
35	NC_017755	AG	6	292122	292132	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_017755	CT	6	301526	301536	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	38509983
37	NC_017755	TC	6	333894	333905	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
38	NC_017755	GC	6	339455	339465	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
39	NC_017755	TA	6	351805	351815	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_017755	AC	6	367434	367444	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_017755	AT	12	372247	372270	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_017755	GA	6	378871	378881	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_017755	AT	6	402862	402874	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_017755	CG	6	405932	405942	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Huperzia squarrosa mitochondrion