ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Boea hygrometrica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016741	TAAC	3	2544	2554	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016741	TTTC	3	3986	3997	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016741	AAAG	3	4485	4495	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016741	ACTT	3	5083	5093	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016741	TTTC	3	5377	5388	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016741	CAAT	3	5861	5871	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016741	GAAA	3	6349	6360	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016741	AAGA	3	9152	9164	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016741	CCTT	3	11013	11023	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016741	TAAG	3	11365	11376	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016741	CTTT	3	11869	11881	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016741	CTTT	3	12817	12828	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016741	TATT	3	14218	14229	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016741	TTCC	3	16945	16956	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016741	TTTC	3	18429	18439	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016741	GGAA	3	18785	18796	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016741	CCGA	3	21457	21467	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016741	CTTT	3	21678	21689	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016741	GGGA	3	21867	21878	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016741	TCCT	3	30889	30901	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016741	CTTT	3	32420	32432	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016741	ACTC	3	32514	32524	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016741	ATTC	4	33296	33312	17	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
24	NC_016741	CCTT	3	36508	36518	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016741	CATT	3	39687	39697	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016741	TTAC	3	40221	40232	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016741	AAAG	3	42207	42217	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016741	GAAA	3	43546	43557	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016741	GATG	3	45080	45092	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	37780697
30	NC_016741	GAAG	3	45190	45201	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37780697
31	NC_016741	AATG	3	46353	46363	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37780697
32	NC_016741	AAGC	3	46405	46415	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	37780697
33	NC_016741	TGAA	3	47126	47137	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37780697
34	NC_016741	GGCA	4	47380	47394	15	25 %	0 %	50 %	25 %	6 %	37780697
35	NC_016741	AATC	3	49192	49202	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	37780697
36	NC_016741	AAGA	3	49796	49808	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	37780697
37	NC_016741	CCTT	3	51283	51294	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37780697
38	NC_016741	GGAT	3	51980	51991	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	37780697
39	NC_016741	TCCT	3	52597	52608	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37780697
40	NC_016741	TTAT	3	54264	54275	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	37780697
41	NC_016741	ACTT	3	54846	54857	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	37780697
42	NC_016741	TCGA	3	56540	56550	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	37780697
43	NC_016741	TGAA	3	57915	57925	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37780697
44	NC_016741	CTTA	3	59998	60010	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	37780697
45	NC_016741	ACCC	3	60823	60834	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	37780697
46	NC_016741	TTCC	3	61908	61919	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37780697
47	NC_016741	GGAG	4	62176	62191	16	25 %	0 %	75 %	0 %	6 %	37780697
48	NC_016741	ATCT	3	64458	64469	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	37780697
49	NC_016741	AATC	3	68754	68765	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	37780697
50	NC_016741	TTCC	3	69969	69979	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37780697
51	NC_016741	AAAG	3	71253	71263	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37780697
52	NC_016741	TAGC	3	71353	71363	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	37780697
53	NC_016741	GATG	4	73162	73177	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	37780697
54	NC_016741	TTCT	3	74726	74737	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37780697
55	NC_016741	GAAA	3	75118	75130	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	37780697
56	NC_016741	TGAA	3	76868	76879	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	37780697
57	NC_016741	CCTT	3	79097	79108	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37780697
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59	NC_016741	TCTT	3	81265	81276	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	37780697
60	NC_016741	TTCC	3	82475	82485	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37780697
61	NC_016741	CTTC	3	83867	83879	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	37780697
62	NC_016741	CAGG	3	95801	95812	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	37780697
63	NC_016741	AAGA	3	95996	96006	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37780697
64	NC_016741	AAGA	4	96925	96940	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	37780697
65	NC_016741	AGGA	3	98962	98973	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	37780697
66	NC_016741	AAAG	3	104507	104518	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37780697
67	NC_016741	GGTT	3	108296	108308	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	37780697
68	NC_016741	GGAA	3	110951	110962	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37780697
69	NC_016741	ACCC	3	115370	115380	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	37780697
70	NC_016741	GGGA	3	122792	122802	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	37780697
71	NC_016741	GCCT	3	123927	123938	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	37780697
72	NC_016741	AAAG	3	124995	125005	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37780697
73	NC_016741	CTAA	3	125883	125893	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	37780697
74	NC_016741	TTTC	3	126039	126049	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37780697
75	NC_016741	ACCC	3	127084	127095	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	37780697
76	NC_016741	AAAG	3	128162	128172	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37780697
77	NC_016741	CTTT	3	128682	128692	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37780697
78	NC_016741	AGAA	3	131596	131606	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37780697
79	NC_016741	GGAC	3	132721	132731	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	37780697
80	NC_016741	CATT	3	133510	133522	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	37780697
81	NC_016741	CCCA	3	134100	134112	13	25 %	0 %	0 %	75 %	7 %	37780697
82	NC_016741	CATC	3	134360	134371	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	37780697
83	NC_016741	AGGT	3	136862	136872	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	37780697
84	NC_016741	TGCT	3	141477	141488	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	37780697
85	NC_016741	GGTA	3	142694	142705	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	37780697
86	NC_016741	CGAT	3	146303	146314	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	37780697
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88	NC_016741	AGGA	3	148446	148456	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37780697
89	NC_016741	GATA	3	149513	149523	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37780697
90	NC_016741	TAGC	3	149624	149635	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	37780697
91	NC_016741	TTCT	3	152954	152965	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	37780697
92	NC_016741	TAAC	3	153475	153486	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	37780697
93	NC_016741	GGAG	3	154972	154984	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	37780697
94	NC_016741	GATA	3	158182	158193	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37780697
95	NC_016741	CTTG	3	158835	158845	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	37780697
96	NC_016741	GCTT	3	160929	160939	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	37780697
97	NC_016741	CTTT	3	161772	161784	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	37780697
98	NC_016741	CCTT	4	162260	162274	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	37780697
99	NC_016741	CTAA	3	164723	164734	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	37780697
100	NC_016741	AACT	3	165820	165830	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	37780697
101	NC_016741	CTAG	3	166171	166181	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	37780697
102	NC_016741	TTTA	3	166444	166456	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	37780697
103	NC_016741	TTTC	3	166834	166844	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37780697
104	NC_016741	AAAG	3	167865	167876	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37780697
105	NC_016741	GAAA	3	169837	169848	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37780697
106	NC_016741	TTCA	3	173206	173216	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37780697
107	NC_016741	CTTT	3	177446	177457	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	37780697
108	NC_016741	TCTT	3	179529	179540	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	37780697
109	NC_016741	AAGA	3	180898	180909	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37780697
110	NC_016741	AAGA	3	185850	185862	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	37780697
111	NC_016741	TGGC	3	186531	186541	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	37780697
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113	NC_016741	CTTA	3	187966	187976	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37780697
114	NC_016741	AGCA	3	188194	188204	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	37780697
115	NC_016741	AAAG	3	190023	190034	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37780697
116	NC_016741	AAGG	3	192692	192702	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37780697
117	NC_016741	ATTT	3	194161	194171	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37780697
118	NC_016741	TTCC	3	196891	196902	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37780697
119	NC_016741	ATTG	3	199989	199999	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	37780697
120	NC_016741	TCTT	3	200114	200125	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37780697
121	NC_016741	ACTA	3	203484	203495	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	37780697
122	NC_016741	CCTT	3	204718	204730	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	37780697
123	NC_016741	TAGA	3	206747	206758	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	37780697
124	NC_016741	TGAG	3	214160	214171	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	37780697
125	NC_016741	GAAA	3	214774	214784	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37780697
126	NC_016741	ATTT	3	215802	215813	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37780697
127	NC_016741	AATA	3	216735	216747	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	37780697
128	NC_016741	AAGA	3	216848	216860	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	37780697
129	NC_016741	ATCA	5	216996	217015	20	50 %	25 %	0 %	25 %	10 %	37780697
130	NC_016741	TTCA	3	220228	220238	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37780697
131	NC_016741	TCCT	3	220535	220546	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37780697
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133	NC_016741	AAGA	3	222876	222887	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37780697
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262	NC_016741	ATCA	3	508408	508419	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
263	NC_016741	AAAG	3	508620	508632	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Boea hygrometrica mitochondrion