ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Boea hygrometrica mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016741AGA4242224331266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
2NC_016741ATT4578557951133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016741GAA4939594061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
4NC_016741CTT41445214462110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
5NC_016741AGC415953159641233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
6NC_016741CCT41708717097110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
7NC_016741CAG417700177111233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
8NC_016741GGT42247922489110 %33.33 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
9NC_016741AAG425652256631266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
10NC_016741GAT426639266491133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
11NC_016741AGA427280272911266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
12NC_016741CTA428258282691233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
13NC_016741GAA428644286551266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
14NC_016741AGA428906289171266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016741GCA429288292991233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
16NC_016741GAA430787307991366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
17NC_016741TCT43315733168120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
18NC_016741ACT433412334221133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
19NC_016741GTG43500635017120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016741CTT44970049712130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37780697
21NC_016741GAA450734507451266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
22NC_016741CTT45092650937120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
23NC_016741CTA452626526371233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37780697
24NC_016741CTA457748577601333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %37780697
25NC_016741AGA460052600621166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37780697
26NC_016741TCT46047560485110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
27NC_016741CTT46268662697120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
28NC_016741ATG463158631701333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %37780697
29NC_016741CAT470242702521133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37780697
30NC_016741CAG470508705181133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %37780697
31NC_016741GTA472970729801133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
32NC_016741AGA474286742971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
33NC_016741TTG47934079350110 %66.67 %33.33 %0 %9 %37780697
34NC_016741TAA490121901321266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37780697
35NC_016741ATA490420904311266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37780697
36NC_016741CTT49337493385120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
37NC_016741CTT49972899738110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
38NC_016741AGA41063461063571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
39NC_016741TAT41069701069801133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37780697
40NC_016741TAA41100021100131266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37780697
41NC_016741AAG41111721111831266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
42NC_016741TCC4112919112929110 %33.33 %0 %66.67 %9 %37780697
43NC_016741GCT4113822113832110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %37780697
44NC_016741AGA41160781160881166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37780697
45NC_016741CAT41162571162671133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37780697
46NC_016741GTT4117451117461110 %66.67 %33.33 %0 %9 %37780697
47NC_016741AGA41265621265741366.67 %0 %33.33 %0 %7 %37780697
48NC_016741CTT4126887126898120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
49NC_016741CGT4127746127758130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %37780697
50NC_016741ACC41289971290091333.33 %0 %0 %66.67 %7 %37780697
51NC_016741CGT4131383131393110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %37780697
52NC_016741TTC4131869131879110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
53NC_016741ATG41325821325921133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
54NC_016741GAA41346501346611266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
55NC_016741ATT41354411354521233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37780697
56NC_016741TCT4136228136239120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
57NC_016741TGA41365391365491133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
58NC_016741GAT41375401375501133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
59NC_016741CTA41451041451151233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37780697
60NC_016741TTG4145890145901120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37780697
61NC_016741CTT4146574146584110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
62NC_016741CTG4146756146767120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37780697
63NC_016741TAT41508991509101233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37780697
64NC_016741ATT41530621530731233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37780697
65NC_016741AGA41536971537071166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37780697
66NC_016741GAA41592641592741166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37780697
67NC_016741TTG4160465160475110 %66.67 %33.33 %0 %9 %37780697
68NC_016741CTT4161100161111120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
69NC_016741TAC41625601625711233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37780697
70NC_016741CTG4163193163204120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37780697
71NC_016741GAG41699571699671133.33 %0 %66.67 %0 %9 %37780697
72NC_016741TTC4170686170697120 %66.67 %0 %33.33 %0 %37780697
73NC_016741CTC4171359171369110 %33.33 %0 %66.67 %9 %37780697
74NC_016741TTA41729691729801233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37780697
75NC_016741TTA41737501737611233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37780697
76NC_016741CTT4174452174462110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
77NC_016741ACT41774241774341133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37780697
78NC_016741GCT4181187181198120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37780697
79NC_016741TTC4184977184988120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
80NC_016741CAA41867441867541166.67 %0 %0 %33.33 %9 %37780697
81NC_016741TAG41921791921891133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
82NC_016741TAG41978481978581133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
83NC_016741GAA52005772005921666.67 %0 %33.33 %0 %6 %37780697
84NC_016741ATG42028412028511133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
85NC_016741TGT4204176204187120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37780697
86NC_016741CTG4206636206647120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37780697
87NC_016741ATA42067112067221266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37780697
88NC_016741GGA42067232067341233.33 %0 %66.67 %0 %8 %37780697
89NC_016741ATC42083762083871233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37780697
90NC_016741GAG42121102121211233.33 %0 %66.67 %0 %8 %37780697
91NC_016741AGT42155242155351233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37780697
92NC_016741AAG42161952162061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
93NC_016741GAT42211702211811233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37780697
94NC_016741TTC4221905221916120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
95NC_016741TAG42240792240901233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37780697
96NC_016741AAG52369202369331466.67 %0 %33.33 %0 %7 %37780697
97NC_016741ATA42371192371291166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37780697
98NC_016741TTA42383332383441233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37780697
99NC_016741TTC5239803239817150 %66.67 %0 %33.33 %6 %37780697
100NC_016741CTT4239899239909110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
101NC_016741CTT4247047247057110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
102NC_016741AGA42470952471061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
103NC_016741GAA42486752486861266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
104NC_016741CTC4255010255021120 %33.33 %0 %66.67 %8 %37780697
105NC_016741AGG52623272623411533.33 %0 %66.67 %0 %6 %37780697
106NC_016741GAA42654182654291266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
107NC_016741TTC4269221269233130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37780697
108NC_016741GTC4269335269346120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37780697
109NC_016741ATA42694952695071366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37780697
110NC_016741CTT4270573270583110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
111NC_016741TCT4272290272301120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
112NC_016741AGA42739552739651166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37780697
113NC_016741TTA42769112769221233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37780697
114NC_016741CTC4277068277079120 %33.33 %0 %66.67 %8 %37780697
115NC_016741CTT4278665278675110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
116NC_016741GAG42787182787281133.33 %0 %66.67 %0 %9 %37780697
117NC_016741CAG42792152792251133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %37780697
118NC_016741ATA72917092917271966.67 %33.33 %0 %0 %10 %37780697
119NC_016741CTT4292605292616120 %66.67 %0 %33.33 %0 %37780697
120NC_016741CTT4296893296904120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
121NC_016741CTA43049853049961233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37780697
122NC_016741TCT4312516312526110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
123NC_016741ATT43140463140571233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37780697
124NC_016741CTT4315917315927110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
125NC_016741CTT4315964315975120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
126NC_016741CTT4318093318105130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37780697
127NC_016741AGT43197973198071133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
128NC_016741CGT4320047320057110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %37780697
129NC_016741TCT4320968320979120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
130NC_016741CTT4324986324997120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
131NC_016741TCT4333306333317120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
132NC_016741TAA43367153367261266.67 %33.33 %0 %0 %0 %37780697
133NC_016741GTC4336735336746120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37780697
134NC_016741ATG53394013394151533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %37780697
135NC_016741TCT4340065340076120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
136NC_016741ATG43414163414261133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
137NC_016741GCA43428043428151233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37780697
138NC_016741TCT4347280347292130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37780697
139NC_016741TGG4349611349622120 %33.33 %66.67 %0 %8 %37780697
140NC_016741TAG43526383526481133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37780697
141NC_016741GAT43555463555571233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37780697
142NC_016741AGT43563103563211233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37780697
143NC_016741AAT43573593573701266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37780697
144NC_016741AAG43623693623801266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780697
145NC_016741AGA43630803630921366.67 %0 %33.33 %0 %7 %37780697
146NC_016741TTC4364629364640120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
147NC_016741AGG43694633694741233.33 %0 %66.67 %0 %8 %37780697
148NC_016741TTC4371078371089120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
149NC_016741CTT4371452371462110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
150NC_016741CTT4376149376160120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
151NC_016741ACT43763913764011133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37780697
152NC_016741CTT4378247378258120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
153NC_016741TCT4378919378931130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37780697
154NC_016741TTG4385138385149120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37780699
155NC_016741TAA43869183869291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37780699
156NC_016741TCC4390992391002110 %33.33 %0 %66.67 %9 %37780699
157NC_016741TCT4396021396032120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780699
158NC_016741GAA43974053974161266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780699
159NC_016741TCT4399554399564110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780699
160NC_016741AGA44040874040981266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37780699
161NC_016741CTT4406419406429110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37780697
162NC_016741ACT44119934120031133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37780697
163NC_016741AGA44125984126091266.67 %0 %33.33 %0 %0 %37780697
164NC_016741TTA44187384187501333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37780697
165NC_016741AAT44200594200711366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37780697
166NC_016741ATT44223294223401233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37780697
167NC_016741GTT4426734426745120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37780697
168NC_016741ATA44301114301221266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37780697
169NC_016741TGG4430683430694120 %33.33 %66.67 %0 %8 %37780697
170NC_016741CTT4430993431004120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37780697
171NC_016741TCC4433012433022110 %33.33 %0 %66.67 %9 %37780697
172NC_016741AAG44408104408211266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
173NC_016741TTA44418154418261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
174NC_016741ATC44432214432321233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
175NC_016741TCA44480854480951133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
176NC_016741ATA44483754483861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
177NC_016741AGA44504634504731166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
178NC_016741ACC44538384538491233.33 %0 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
179NC_016741TAT44559374559491333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
180NC_016741ATA44559484559601366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
181NC_016741GCT4457698457708110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
182NC_016741ATA44610004610121366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37780698
183NC_016741CTT4461729461741130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37780698
184NC_016741TCT4462708462719120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
185NC_016741AGA44720654720761266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
186NC_016741TTA54730534730661433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
187NC_016741CAA44745114745221266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
188NC_016741TGT4475841475851110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
189NC_016741TTA44820344820441133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
190NC_016741AAG44831754831861266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
191NC_016741TCT4484751484761110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
192NC_016741AGA44848994849101266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
193NC_016741AGG44894224894321133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
194NC_016741AGA44897214897331366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
195NC_016741ATT44898314898421233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
196NC_016741TAT44901154901261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
197NC_016741ATA44901464901581366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
198NC_016741TTC4490559490569110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
199NC_016741CTA44931834931941233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37780698
200NC_016741ATT44981374981481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
201NC_016741CGA44985394985501233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
202NC_016741GAG44992454992561233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
203NC_016741CCT4499999500011130 %33.33 %0 %66.67 %7 %Non-Coding
204NC_016741GCA45001095001201233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
205NC_016741CAG45001655001751133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
206NC_016741CTT4500270500280110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
207NC_016741AGA45049615049721266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
208NC_016741GCA45055445055551233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
209NC_016741AGA45071095071191166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
210NC_016741AAG45087015087121266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
211NC_016741AAC45100475100571166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
212NC_016741GAC45104125104231233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
213NC_016741GGT4510467510477110 %33.33 %66.67 %0 %9 %Non-Coding