ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Heliconema longissimum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016127	TTA	4	613	625	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352673
2	NC_016127	ATT	4	648	659	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352673
3	NC_016127	ATT	4	766	776	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352673
4	NC_016127	AT	6	902	912	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35352673
5	NC_016127	TTTA	4	1063	1078	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35352673
6	NC_016127	T	13	1278	1290	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35352673
7	NC_016127	GTT	4	1505	1516	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	35352673
8	NC_016127	T	28	1952	1979	28	0 %	100 %	0 %	0 %	3 %	35352673
9	NC_016127	TA	7	2035	2047	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35352673
10	NC_016127	ATTT	3	2190	2201	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016127	AT	7	2424	2436	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35352673
12	NC_016127	T	12	2491	2502	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	35352673
13	NC_016127	TTA	4	2795	2806	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352673
14	NC_016127	TTTTG	3	3170	3184	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	35352673
15	NC_016127	AATTA	3	3816	3829	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	35352673
16	NC_016127	TAA	5	3847	3861	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35352673
17	NC_016127	TTGT	3	3862	3873	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	35352673
18	NC_016127	TAT	4	3876	3888	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352673
19	NC_016127	TA	24	4373	4417	45	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016127	TTAA	5	4431	4449	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
21	NC_016127	ATAA	4	4593	4608	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016127	TTTG	3	5223	5234	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016127	TA	6	5264	5274	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016127	TAAA	3	5933	5944	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35352673
25	NC_016127	T	16	5980	5995	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	35352673
26	NC_016127	T	14	6047	6060	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35352673
27	NC_016127	TTTCTT	3	6202	6219	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	35352673
28	NC_016127	TAT	4	6277	6289	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352673
29	NC_016127	ATT	4	6513	6524	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352673
30	NC_016127	ATT	4	6691	6702	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352673
31	NC_016127	T	12	6698	6709	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35352673
32	NC_016127	TATT	5	6715	6734	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	35352673
33	NC_016127	T	12	6790	6801	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35352673
34	NC_016127	T	16	7167	7182	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	35352673
35	NC_016127	ATA	4	7508	7518	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35352673
36	NC_016127	TTTA	3	8062	8074	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	35352673
37	NC_016127	TTAATT	3	8256	8273	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_016127	T	12	8486	8497	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016127	TTAT	4	8755	8770	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016127	ATT	4	9023	9035	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016127	ATT	4	9315	9325	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352673
42	NC_016127	TAT	4	9326	9337	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352673
43	NC_016127	T	28	9356	9383	28	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35352673
44	NC_016127	AT	6	9445	9455	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016127	GTATA	3	9608	9622	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016127	TTTA	3	9743	9754	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35352673
47	NC_016127	TTGTT	4	9957	9976	20	0 %	80 %	20 %	0 %	5 %	35352673
48	NC_016127	TTTTA	3	10062	10077	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	35352673
49	NC_016127	ATT	4	10659	10670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352673
50	NC_016127	TAT	4	10922	10933	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352673
51	NC_016127	TTAT	3	11031	11042	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35352673
52	NC_016127	TTTA	3	11333	11345	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016127	ATT	4	11396	11406	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016127	TAT	5	11625	11640	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35352674
55	NC_016127	TAA	5	11916	11929	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35352674
56	NC_016127	ATT	5	11958	11971	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352674
57	NC_016127	T	18	12272	12289	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35352674
58	NC_016127	T	27	12416	12442	27	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35352674
59	NC_016127	T	12	12488	12499	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35352674
60	NC_016127	TTA	4	12736	12746	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352674
61	NC_016127	TAT	4	12785	12797	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352674
62	NC_016127	ATTTT	3	12813	12826	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	35352674
63	NC_016127	ATTT	3	12828	12839	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35352674
64	NC_016127	TTTA	3	12891	12901	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35352674
65	NC_016127	TTTA	3	13324	13334	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35352674
66	NC_016127	ATTT	3	13418	13429	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35352674
67	NC_016127	TATT	4	13472	13488	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	35352674
68	NC_016127	TTA	4	13513	13523	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352674
69	NC_016127	TTTA	3	13591	13602	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35352674

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Heliconema longissimum mitochondrion