ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ichthyophthirius multifiliis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015981	TAA	4	173	184	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015981	TAA	4	398	409	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015981	TAA	4	623	634	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015981	CAG	4	2273	2283	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015981	TAT	4	3721	3731	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589411
6	NC_015981	TAA	4	3914	3926	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589411
7	NC_015981	AAT	5	4335	4350	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34589411
8	NC_015981	GTA	4	7569	7579	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34589412
9	NC_015981	TAT	4	7804	7814	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589412
10	NC_015981	TAT	4	8203	8214	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589412
11	NC_015981	ATA	4	9171	9181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589412
12	NC_015981	CAC	4	10129	10140	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	0 %	34589412
13	NC_015981	TAT	4	10752	10764	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589412
14	NC_015981	ATT	4	11700	11711	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	34589412
15	NC_015981	ATA	6	11850	11866	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34589412
16	NC_015981	ATA	4	11917	11927	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589412
17	NC_015981	AAT	4	11930	11941	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589412
18	NC_015981	CAT	4	12105	12115	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	34589412
19	NC_015981	ATT	5	13658	13672	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589413
20	NC_015981	ATT	5	14506	14520	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589413
21	NC_015981	ATA	4	14552	14564	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589413
22	NC_015981	ATT	4	15375	15386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589413
23	NC_015981	ATT	4	16008	16019	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589413
24	NC_015981	ATA	5	18768	18781	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589413
25	NC_015981	ATA	4	19307	19317	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589413
26	NC_015981	TAA	4	19618	19628	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589413
27	NC_015981	TTA	4	20565	20575	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589414
28	NC_015981	TAA	4	21142	21153	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	34589414
29	NC_015981	ATT	5	21559	21574	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589414
30	NC_015981	TAA	4	21685	21695	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589414
31	NC_015981	TAA	7	23414	23435	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589414
32	NC_015981	ATA	4	23727	23739	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589414
33	NC_015981	ATA	4	24433	24444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589414
34	NC_015981	TAT	5	24665	24678	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589414
35	NC_015981	TAT	4	25727	25738	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589414
36	NC_015981	TTA	5	25747	25761	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589414
37	NC_015981	TAT	4	25873	25884	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589414
38	NC_015981	ATT	4	25916	25930	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589414
39	NC_015981	TAT	5	25996	26010	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_015981	ATT	5	26135	26149	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015981	ATA	5	26153	26167	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_015981	TAA	5	27468	27483	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_015981	TAA	4	27559	27570	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_015981	TTA	4	28627	28639	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589414
45	NC_015981	TAT	4	29432	29442	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589414
46	NC_015981	ATA	4	29799	29809	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589414
47	NC_015981	ATT	4	30262	30273	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589414
48	NC_015981	CTT	4	30723	30734	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34589414
49	NC_015981	TAT	7	31590	31610	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589414
50	NC_015981	ATT	7	31846	31869	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	34589414
51	NC_015981	AAT	4	32610	32620	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589414
52	NC_015981	ATC	4	33373	33383	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	34589414
53	NC_015981	TTA	4	34190	34200	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_015981	ATT	4	34731	34741	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_015981	ATA	4	35706	35717	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589414
56	NC_015981	ATA	4	35841	35852	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589414
57	NC_015981	TAA	4	36784	36795	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589414
58	NC_015981	TAA	5	37044	37058	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34589415
59	NC_015981	ATT	4	37623	37635	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589415
60	NC_015981	TAT	4	37988	38000	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589415
61	NC_015981	TAT	4	38482	38492	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589415
62	NC_015981	ATA	4	40179	40190	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589415
63	NC_015981	TAG	4	40921	40932	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34589415
64	NC_015981	TAT	4	41793	41804	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589415
65	NC_015981	TAT	4	41831	41843	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589415
66	NC_015981	ATT	5	41957	41971	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589415
67	NC_015981	TAA	4	42869	42880	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589415
68	NC_015981	ATA	4	43038	43048	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589415
69	NC_015981	ATT	5	43228	43241	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589415
70	NC_015981	ATT	4	43529	43541	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589415
71	NC_015981	ATA	7	45219	45240	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589415
72	NC_015981	TAT	4	48457	48468	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_015981	TAT	4	48682	48693	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_015981	TAT	4	48907	48918	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_015981	TAT	4	49132	49143	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_015981	TAT	4	49357	49368	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_015981	TAT	4	49582	49593	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_015981	TAT	4	49807	49818	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_015981	TAT	4	50032	50043	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_015981	TAT	4	50257	50268	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_015981	TAT	4	50482	50493	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_015981	TAT	4	50707	50718	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_015981	TAT	4	50932	50943	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_015981	TAT	4	51157	51168	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_015981	TAT	4	51382	51393	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_015981	TAT	4	51607	51618	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ichthyophthirius multifiliis mitochondrion