ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Ichthyophthirius multifiliis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015981	TA	9	1219	1235	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_015981	CT	6	2488	2498	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015981	AT	6	3171	3183	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_015981	TA	7	3237	3250	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_015981	AT	6	4598	4608	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589411
6	NC_015981	AT	6	5015	5025	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589411
7	NC_015981	AT	9	5028	5045	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34589411
8	NC_015981	TA	6	5186	5197	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589411
9	NC_015981	TA	6	8805	8815	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589412
10	NC_015981	AT	9	9037	9053	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34589412
11	NC_015981	TA	8	10425	10440	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589412
12	NC_015981	AT	9	12261	12278	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34589413
13	NC_015981	TA	12	12609	12630	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
14	NC_015981	AT	7	14421	14434	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589413
15	NC_015981	TA	10	14693	14715	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589413
16	NC_015981	TA	6	15077	15087	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
17	NC_015981	AT	6	15457	15467	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
18	NC_015981	TA	6	15593	15603	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
19	NC_015981	TA	6	15967	15977	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
20	NC_015981	TA	6	16108	16118	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
21	NC_015981	AT	6	16202	16213	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589413
22	NC_015981	AT	6	16636	16646	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
23	NC_015981	TA	7	17107	17122	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_015981	TA	7	17674	17686	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589413
25	NC_015981	AT	7	18534	18546	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589413
26	NC_015981	AT	7	18673	18687	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589413
27	NC_015981	AT	7	19078	19092	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589413
28	NC_015981	TA	6	21040	21050	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589414
29	NC_015981	AT	6	21878	21888	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589414
30	NC_015981	AT	6	22538	22551	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589414
31	NC_015981	AT	6	23123	23133	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589414
32	NC_015981	AT	6	23318	23331	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589414
33	NC_015981	AT	6	24285	24295	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589414
34	NC_015981	TA	7	24632	24644	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589414
35	NC_015981	AT	7	25276	25288	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589414
36	NC_015981	TA	7	25795	25810	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589414
37	NC_015981	TA	6	26024	26034	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_015981	TA	13	26039	26063	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_015981	AT	13	26233	26257	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015981	AT	7	26284	26299	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_015981	AT	6	26389	26402	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_015981	AT	20	26732	26768	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_015981	TA	7	27118	27131	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_015981	AT	6	27178	27189	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_015981	TA	7	27399	27411	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_015981	TA	6	30447	30458	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589414
47	NC_015981	AT	6	31653	31663	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589414
48	NC_015981	AT	8	33702	33717	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_015981	TA	6	33822	33833	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_015981	TA	7	34241	34254	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_015981	TA	7	34753	34765	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_015981	TA	6	34793	34803	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_015981	AT	6	35895	35905	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589414
54	NC_015981	TA	7	36842	36856	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_015981	TA	6	37097	37108	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589415
56	NC_015981	AT	7	37317	37329	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589415
57	NC_015981	TA	6	41030	41042	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589415
58	NC_015981	TA	12	41896	41918	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589415
59	NC_015981	TA	6	42191	42201	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589415
60	NC_015981	TA	6	43090	43101	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589415
61	NC_015981	TA	8	43125	43139	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589415
62	NC_015981	TA	6	45029	45040	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589415
63	NC_015981	TA	7	45841	45854	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_015981	TA	7	45910	45922	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_015981	AG	6	46593	46603	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_015981	TA	7	47859	47873	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Ichthyophthirius multifiliis mitochondrion