ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna radiata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015121	CGTTCT	3	12709	12727	19	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	10 %	32314904
2	NC_015121	GTAATA	3	15569	15585	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	32314904
3	NC_015121	GCTCCA	3	57561	57579	19	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	10 %	32314904
4	NC_015121	AGAAAC	3	62266	62283	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	32314904
5	NC_015121	TTTTCT	3	83570	83587	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	32314904
6	NC_015121	AAAAGG	3	83848	83866	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	32314904
7	NC_015121	CATTGG	3	130139	130156	18	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32314903
8	NC_015121	ATGGAC	3	137278	137295	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	32314903
9	NC_015121	CTTAGT	3	158138	158155	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32314903
10	NC_015121	TTCCAC	3	159518	159535	18	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	32314903
11	NC_015121	CTATCT	3	174028	174044	17	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	32314903
12	NC_015121	TTTTTG	3	205551	205569	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	32314903
13	NC_015121	AAAAAG	3	206448	206466	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	32314903
14	NC_015121	AAAAAT	3	215820	215836	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	32314903
15	NC_015121	ATAAAA	3	219103	219120	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	32314903
16	NC_015121	AAGCTA	3	221154	221170	17	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	32314903
17	NC_015121	CTCTTT	4	233078	233102	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32314903
18	NC_015121	TTAATG	3	236190	236207	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	32314903
19	NC_015121	TCTTTC	3	239538	239556	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	32314903
20	NC_015121	TCACTA	3	290435	290451	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	32314903
21	NC_015121	ACAGAG	3	303070	303087	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	32314903
22	NC_015121	CTATAC	3	309560	309577	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	32314903
23	NC_015121	GACCAG	3	313360	313377	18	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	5 %	32314903
24	NC_015121	AAAGAA	3	323252	323270	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	32314903
25	NC_015121	TTTTCT	3	363247	363265	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
26	NC_015121	TCTTTC	3	372455	372472	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
27	NC_015121	TCTAGC	4	378319	378342	24	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	4 %	Non-Coding
28	NC_015121	CAAATG	3	394301	394319	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna radiata mitochondrion