ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Boreus elegans mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015119	TCT	4	189	200	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015119	ATT	4	223	234	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	32283070
3	NC_015119	ATT	4	823	834	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	32283070
4	NC_015119	TTA	4	938	949	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	32283070
5	NC_015119	TTA	4	1214	1224	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	32283070
6	NC_015119	TAA	4	2874	2884	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32283070
7	NC_015119	TTA	4	3126	3138	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	32283070
8	NC_015119	ACA	4	3203	3213	11	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32283070
9	NC_015119	ATT	4	3281	3291	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	32283070
10	NC_015119	ATT	4	4101	4113	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	32283070
11	NC_015119	AAT	4	4701	4712	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32283071
12	NC_015119	TAA	4	4768	4779	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32283071
13	NC_015119	ATT	4	5368	5379	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	32283071
14	NC_015119	TAT	5	5838	5851	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	32283071
15	NC_015119	ATT	5	7181	7195	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	32283071
16	NC_015119	TAA	4	7291	7302	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32283071
17	NC_015119	TAA	4	7725	7737	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	32283071
18	NC_015119	TAA	4	7765	7775	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32283071
19	NC_015119	TTA	4	7944	7954	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	32283071
20	NC_015119	TAA	5	7953	7966	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	32283071
21	NC_015119	ATT	5	7967	7981	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	32283071
22	NC_015119	TAA	4	8164	8178	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	32283071
23	NC_015119	ATT	5	8723	8737	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32283071
24	NC_015119	TAT	4	8946	8958	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	32283071
25	NC_015119	TAA	5	9151	9165	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	32283071
26	NC_015119	ATA	4	9187	9198	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32283071
27	NC_015119	TAA	4	9223	9234	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32283071
28	NC_015119	AAT	4	9416	9426	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32283071
29	NC_015119	ATA	4	10245	10255	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32283071
30	NC_015119	TAT	5	11382	11395	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	32283071
31	NC_015119	TAA	4	12006	12017	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32283071
32	NC_015119	CTA	4	12486	12497	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32283071
33	NC_015119	TAA	4	12507	12519	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	32283071
34	NC_015119	TAA	4	13520	13530	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_015119	ATA	4	14150	14160	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_015119	ATT	4	14579	14590	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_015119	TAA	4	16007	16019	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_015119	ATA	4	16126	16138	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_015119	TAA	4	16246	16258	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_015119	ATA	4	16365	16377	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_015119	TAA	4	16485	16497	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_015119	ATA	4	16604	16616	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_015119	ATA	5	16740	16754	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Boreus elegans mitochondrion