ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hydaropsis longirostris mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012456	ATT	5	401	414	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	226464024
2	NC_012456	ATAATT	5	476	505	30	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	226464024
3	NC_012456	ATTT	3	637	648	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	226464024
4	NC_012456	ATA	4	812	823	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464024
5	NC_012456	TTTA	3	849	859	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	226464024
6	NC_012456	TATAA	3	1660	1673	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	226464025
7	NC_012456	TAT	4	5758	5769	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464030
8	NC_012456	TAA	4	6299	6311	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226464031
9	NC_012456	ATAA	5	6785	6804	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	226464031
10	NC_012456	TTA	4	7070	7081	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464031
11	NC_012456	ATA	5	7175	7188	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226464031
12	NC_012456	AAGC	3	7349	7359	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	226464031
13	NC_012456	TAA	4	7604	7615	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464031
14	NC_012456	AAAAT	3	7634	7649	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	226464031
15	NC_012456	AAAAT	3	7879	7893	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	226464031
16	NC_012456	ATT	4	7958	7969	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_012456	TTA	4	8324	8336	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	226464032
18	NC_012456	AAG	4	8442	8453	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	226464032
19	NC_012456	TAAA	3	8605	8615	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226464032
20	NC_012456	AAAATA	4	8968	8990	23	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	226464032
21	NC_012456	TTA	4	9024	9035	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464032
22	NC_012456	TTA	4	9800	9811	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464033
23	NC_012456	ATA	4	10117	10128	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464033
24	NC_012456	TA	6	10514	10524	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226464034
25	NC_012456	AAAT	3	11332	11343	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226464034
26	NC_012456	AATA	3	11472	11482	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226464035
27	NC_012456	AGAA	3	11605	11615	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	226464035
28	NC_012456	ATA	4	11658	11669	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464035
29	NC_012456	ATAA	3	11683	11694	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226464035
30	NC_012456	TAAAA	3	12041	12054	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	226464035
31	NC_012456	ATT	4	13311	13321	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_012456	TAT	4	13414	13424	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_012456	ATA	4	13453	13463	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_012456	TTAA	3	13549	13561	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_012456	AAAC	3	13660	13670	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_012456	AAAAAT	3	14235	14253	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
37	NC_012456	ACAA	3	14424	14435	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_012456	CCCT	3	14569	14579	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
39	NC_012456	TC	7	14847	14859	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
40	NC_012456	AAAT	3	15239	15250	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_012456	ATAA	3	15955	15966	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_012456	TTAAA	3	16011	16025	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hydaropsis longirostris mitochondrion