ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Perfect Repeats of Vitis vinifera mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012119	GGGA	3	16456	16467	12	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012119	TCAT	3	21961	21972	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436561
3	NC_012119	ATGA	3	46831	46842	12	50 %	25 %	25 %	0 %	22436561
4	NC_012119	TCGG	3	47900	47911	12	0 %	25 %	50 %	25 %	22436561
5	NC_012119	GCTA	3	50758	50769	12	25 %	25 %	25 %	25 %	22436561
6	NC_012119	AGTG	3	63626	63637	12	25 %	25 %	50 %	0 %	22436561
7	NC_012119	TTCC	3	68516	68527	12	0 %	50 %	0 %	50 %	22436561
8	NC_012119	GAAA	3	99712	99723	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436561
9	NC_012119	ATCT	3	108974	108985	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436561
10	NC_012119	AGAA	3	110794	110805	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436561
11	NC_012119	TTCT	3	114478	114489	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436561
12	NC_012119	TCTT	3	139484	139495	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436561
13	NC_012119	AGAA	3	140255	140266	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436561
14	NC_012119	TGGA	3	145631	145642	12	25 %	25 %	50 %	0 %	22436561
15	NC_012119	ATCA	3	151651	151662	12	50 %	25 %	0 %	25 %	22436561
16	NC_012119	TCTA	3	157266	157277	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436561
17	NC_012119	CTAT	3	159371	159382	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436561
18	NC_012119	GAAG	3	169391	169402	12	50 %	0 %	50 %	0 %	22436561
19	NC_012119	GAAA	3	171237	171248	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436561
20	NC_012119	CAAC	3	173862	173873	12	50 %	0 %	0 %	50 %	22436561
21	NC_012119	TTAT	3	184218	184229	12	25 %	75 %	0 %	0 %	22436561
22	NC_012119	CGGC	3	188851	188862	12	0 %	0 %	50 %	50 %	22436561
23	NC_012119	CATT	3	205434	205445	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
24	NC_012119	GGCG	3	208263	208274	12	0 %	0 %	75 %	25 %	22436563
25	NC_012119	CTTG	3	244034	244045	12	0 %	50 %	25 %	25 %	22436563
26	NC_012119	TTAA	6	244654	244677	24	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
27	NC_012119	AGAA	3	247743	247754	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436563
28	NC_012119	TTAT	4	259588	259603	16	25 %	75 %	0 %	0 %	22436563
29	NC_012119	AATC	3	285572	285583	12	50 %	25 %	0 %	25 %	22436563
30	NC_012119	CTTA	3	291829	291840	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
31	NC_012119	GTTT	3	311994	312005	12	0 %	75 %	25 %	0 %	22436563
32	NC_012119	ACTC	3	320651	320662	12	25 %	25 %	0 %	50 %	22436563
33	NC_012119	TTAG	3	340409	340420	12	25 %	50 %	25 %	0 %	22436563
34	NC_012119	TCCA	3	346805	346816	12	25 %	25 %	0 %	50 %	22436563
35	NC_012119	GCCC	3	353945	353956	12	0 %	0 %	25 %	75 %	22436563
36	NC_012119	GGAA	3	355548	355559	12	50 %	0 %	50 %	0 %	22436563
37	NC_012119	AATG	3	368869	368880	12	50 %	25 %	25 %	0 %	22436563
38	NC_012119	ATTC	3	369505	369516	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
39	NC_012119	TCTT	3	383592	383603	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563
40	NC_012119	ATTG	3	394085	394096	12	25 %	50 %	25 %	0 %	22436563
41	NC_012119	ACTA	3	413688	413699	12	50 %	25 %	0 %	25 %	22436563
42	NC_012119	CATT	3	428315	428326	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
43	NC_012119	GTAT	3	430494	430505	12	25 %	50 %	25 %	0 %	22436563
44	NC_012119	TCCA	3	487621	487632	12	25 %	25 %	0 %	50 %	22436563
45	NC_012119	ATAC	3	513249	513260	12	50 %	25 %	0 %	25 %	22436563
46	NC_012119	TGAC	3	537205	537216	12	25 %	25 %	25 %	25 %	22436563
47	NC_012119	GATG	4	538138	538153	16	25 %	25 %	50 %	0 %	22436563
48	NC_012119	GCAA	3	547530	547541	12	50 %	0 %	25 %	25 %	22436563
49	NC_012119	TTCA	3	562041	562052	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
50	NC_012119	TAAG	3	562466	562477	12	50 %	25 %	25 %	0 %	22436563
51	NC_012119	AGGC	3	563768	563779	12	25 %	0 %	50 %	25 %	22436563
52	NC_012119	CTTT	3	576808	576819	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563
53	NC_012119	GCTA	3	586888	586899	12	25 %	25 %	25 %	25 %	22436563
54	NC_012119	ATTG	5	588458	588477	20	25 %	50 %	25 %	0 %	22436563
55	NC_012119	CTTT	3	595812	595823	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563
56	NC_012119	AAGA	3	604487	604498	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436563
57	NC_012119	AAGG	3	609693	609704	12	50 %	0 %	50 %	0 %	22436563
58	NC_012119	GTCT	3	616190	616201	12	0 %	50 %	25 %	25 %	22436563
59	NC_012119	TTCT	3	616689	616700	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563
60	NC_012119	ATAA	3	629979	629990	12	75 %	25 %	0 %	0 %	22436563
61	NC_012119	AATA	3	634567	634578	12	75 %	25 %	0 %	0 %	22436563
62	NC_012119	CTTT	3	635002	635013	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563
63	NC_012119	TAAA	22	641091	641178	88	75 %	25 %	0 %	0 %	22436563
64	NC_012119	TTTC	3	642216	642227	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563
65	NC_012119	GAAT	3	650291	650302	12	50 %	25 %	25 %	0 %	22436563
66	NC_012119	AAGA	3	653765	653776	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436563
67	NC_012119	AGGA	3	683584	683595	12	50 %	0 %	50 %	0 %	22436563
68	NC_012119	AGAA	3	694210	694221	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436563
69	NC_012119	GAGC	3	694579	694590	12	25 %	0 %	50 %	25 %	22436563
70	NC_012119	TGCT	3	695485	695496	12	0 %	50 %	25 %	25 %	22436563
71	NC_012119	GGCC	3	697178	697189	12	0 %	0 %	50 %	50 %	22436563
72	NC_012119	GAAA	3	703993	704004	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436563
73	NC_012119	CTTT	3	736335	736346	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563
74	NC_012119	CTTT	4	736355	736370	16	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563
75	NC_012119	AAAC	3	744661	744672	12	75 %	0 %	0 %	25 %	22436563
76	NC_012119	AAAG	3	746507	746518	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436563
77	NC_012119	CCAG	3	753853	753864	12	25 %	0 %	25 %	50 %	22436563
78	NC_012119	CTTT	3	761481	761492	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Perfect Repeats of Vitis vinifera mitochondrion