ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Bombus hypocrita sapporensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011923	ATA	4	100	111	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_011923	TA	13	152	175	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_011923	ATA	4	223	235	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_011923	AAT	4	240	251	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_011923	ATT	8	283	307	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_011923	TTA	5	324	337	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_011923	TA	11	334	354	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_011923	AT	8	387	403	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_011923	AATT	3	448	458	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_011923	TAA	5	500	515	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_011923	TA	11	536	558	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_011923	TA	18	640	673	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_011923	ATATTA	3	1019	1035	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	22114340
14	NC_011923	ATTT	3	1220	1231	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	22114340
15	NC_011923	TTA	4	1564	1575	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22114340
16	NC_011923	ATTTA	4	1725	1744	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	22114340
17	NC_011923	TTTAAA	3	1761	1779	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
18	NC_011923	AT	18	1802	1836	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_011923	AATT	3	2227	2238	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22114340
20	NC_011923	AGG	4	2658	2669	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	22114340
21	NC_011923	ATTA	3	3468	3479	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22114340
22	NC_011923	AAAAAT	3	3523	3540	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	22114340
23	NC_011923	TA	11	3579	3601	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_011923	TTA	4	3659	3670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_011923	ATA	7	3820	3840	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22114340
26	NC_011923	AATC	3	4115	4126	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	22114340
27	NC_011923	TTAA	3	4268	4279	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22114340
28	NC_011923	A	12	4402	4413	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	22114340
29	NC_011923	AATT	3	4422	4433	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22114340
30	NC_011923	TTTAAT	4	4614	4637	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	22114340
31	NC_011923	ATT	4	4747	4757	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22114340
32	NC_011923	ATT	4	4788	4798	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22114340
33	NC_011923	TTTAAT	3	5210	5227	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	22114340
34	NC_011923	AAT	4	5603	5613	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22114340
35	NC_011923	TTAA	3	6147	6158	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22114340
36	NC_011923	ATT	4	6159	6169	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_011923	ATTA	4	6186	6201	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_011923	ATTT	5	6275	6293	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	22114340
39	NC_011923	ATT	6	6296	6313	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	22114340
40	NC_011923	TAAA	3	6343	6354	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	22114340
41	NC_011923	T	12	6540	6551	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	22114340
42	NC_011923	AT	12	6703	6726	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_011923	TAA	4	6759	6769	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_011923	TAAT	3	6864	6875	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011923	TAA	4	6888	6899	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_011923	ATT	4	6927	6938	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_011923	AT	6	6958	6969	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_011923	AT	22	7083	7123	41	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22114340
49	NC_011923	A	13	7444	7456	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	22114340
50	NC_011923	TAAAT	3	7534	7547	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	22114340
51	NC_011923	ATT	4	7558	7570	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	22114340
52	NC_011923	TAAT	4	8009	8024	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	22114340
53	NC_011923	ATCC	3	8337	8349	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	22114340
54	NC_011923	ATAA	3	8590	8601	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	22114340
55	NC_011923	AATT	3	8656	8668	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22114340
56	NC_011923	TTATA	3	8705	8718	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_011923	TAAA	4	8760	8775	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	22114340
58	NC_011923	TAAA	3	8778	8790	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	22114340
59	NC_011923	ATT	4	9175	9186	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22114340
60	NC_011923	ATAA	3	9353	9364	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	22114340
61	NC_011923	AT	6	9491	9501	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22114340
62	NC_011923	A	13	9574	9586	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	22114340
63	NC_011923	TAAAA	3	9795	9808	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	22114340
64	NC_011923	ATT	4	9903	9914	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22114340
65	NC_011923	AATT	3	10010	10022	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22114340
66	NC_011923	TAAA	3	10256	10266	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	22114341
67	NC_011923	TA	16	10347	10378	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_011923	TATAA	3	10516	10531	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_011923	TAAAAA	3	10542	10559	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	22114341
70	NC_011923	TTA	6	10614	10632	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	22114341
71	NC_011923	ATA	4	10821	10832	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22114341
72	NC_011923	TAA	4	10992	11003	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22114341
73	NC_011923	TTTA	3	11351	11361	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	22114341
74	NC_011923	AAAT	3	12024	12034	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	22114341
75	NC_011923	ATTA	6	12344	12367	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_011923	AT	15	12442	12469	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22114341
77	NC_011923	TAA	4	12525	12536	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22114341
78	NC_011923	TATT	4	13470	13485	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_011923	AAT	4	13486	13497	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_011923	TTAA	3	13617	13627	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_011923	TA	6	13940	13951	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_011923	TA	9	14147	14163	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_011923	ATTA	4	14191	14205	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_011923	TAATT	3	14225	14239	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_011923	TA	6	14259	14270	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_011923	TAATT	3	14973	14988	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_011923	ATT	4	15104	15114	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_011923	TA	6	15349	15359	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_011923	ATTA	5	15435	15455	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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