ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Blastocystis sp. NandII mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011213	ATT	4	566	577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000404
2	NC_011213	ATT	5	960	974	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	20000404
3	NC_011213	TAA	4	4365	4375	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_011213	ATT	4	4895	4906	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_011213	TAT	4	5788	5798	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20000404
6	NC_011213	TAT	5	6004	6018	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	20000404
7	NC_011213	TAA	4	6047	6058	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_011213	TGG	4	6721	6732	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	20000405
9	NC_011213	AAC	4	6887	6897	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	20000405
10	NC_011213	AAT	4	7573	7583	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000405
11	NC_011213	ATT	4	8041	8052	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000405
12	NC_011213	ATA	4	9984	9994	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000405
13	NC_011213	ATA	4	10085	10096	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000405
14	NC_011213	AAT	5	10274	10289	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	20000405
15	NC_011213	ATT	4	10425	10435	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20000405
16	NC_011213	TAT	5	11694	11707	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	20000405
17	NC_011213	ATT	4	12213	12223	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20000405
18	NC_011213	ATT	4	12504	12514	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20000405
19	NC_011213	ATA	4	12889	12902	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	20000405
20	NC_011213	ATT	4	13680	13693	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	20000405
21	NC_011213	TAA	4	14278	14289	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000405
22	NC_011213	TTA	4	14531	14542	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000405
23	NC_011213	TAT	4	14695	14706	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000405
24	NC_011213	TAA	4	14736	14746	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_011213	TTA	4	15891	15903	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	20000406
26	NC_011213	TAA	4	15952	15964	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	20000406
27	NC_011213	TAA	4	16286	16297	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000406
28	NC_011213	TAA	5	16409	16423	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	20000406
29	NC_011213	ATA	4	16433	16443	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000406
30	NC_011213	ATA	7	16514	16534	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000406
31	NC_011213	ATT	4	16656	16667	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000406
32	NC_011213	ATA	4	17120	17130	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000406
33	NC_011213	TAA	4	17557	17568	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000406
34	NC_011213	TAA	4	17899	17910	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	20000406
35	NC_011213	TAA	4	18944	18955	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000406
36	NC_011213	TAT	4	20809	20820	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000406
37	NC_011213	TAA	4	21085	21096	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000406
38	NC_011213	TTA	4	21494	21504	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20000406
39	NC_011213	TAT	5	21533	21546	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	20000406
40	NC_011213	ATA	4	21614	21624	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000406
41	NC_011213	TAA	4	22395	22406	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000406
42	NC_011213	ATA	5	22582	22595	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	20000406
43	NC_011213	AAT	4	22760	22772	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	20000406
44	NC_011213	TAA	4	24538	24549	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000406
45	NC_011213	ATT	4	24580	24591	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000406
46	NC_011213	TAT	4	25679	25689	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20000407
47	NC_011213	GCA	4	26498	26509	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	20000407
48	NC_011213	ATA	4	26724	26736	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_011213	TAA	5	27573	27587	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	20000407

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Blastocystis sp. NandII mitochondrion