ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Blastocystis sp. NandII mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_011213ATGT34945041125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
2NC_011213T16544559160 %100 %0 %0 %6 %20000404
3NC_011213ATT45665771233.33 %66.67 %0 %0 %8 %20000404
4NC_011213TTAT37928041325 %75 %0 %0 %7 %20000404
5NC_011213ATT59609741533.33 %66.67 %0 %0 %6 %20000404
6NC_011213AAATA4130013181980 %20 %0 %0 %10 %Non-Coding
7NC_011213TTACT3224822621520 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
8NC_011213TA6283828491250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_011213TAAA3320532171375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
10NC_011213TAA4436543751166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
11NC_011213TTTTTA3469647141916.67 %83.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
12NC_011213TATAAA3480048181966.67 %33.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
13NC_011213ATT4489549061233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_011213TTTA3565556651125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
15NC_011213TAT4578857981133.33 %66.67 %0 %0 %9 %20000404
16NC_011213GTTT358525863120 %75 %25 %0 %8 %20000404
17NC_011213TAT5600460181533.33 %66.67 %0 %0 %6 %20000404
18NC_011213TAA4604760581266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_011213TGG467216732120 %33.33 %66.67 %0 %8 %20000405
20NC_011213TAAA3680168111175 %25 %0 %0 %9 %20000405
21NC_011213AAC4688768971166.67 %0 %0 %33.33 %9 %20000405
22NC_011213A127064707512100 %0 %0 %0 %8 %20000405
23NC_011213AAAT4714471581575 %25 %0 %0 %6 %20000405
24NC_011213TATT3723072411225 %75 %0 %0 %0 %20000405
25NC_011213AT6728172921250 %50 %0 %0 %8 %20000405
26NC_011213TA9735873741750 %50 %0 %0 %5 %20000405
27NC_011213AT9745074661750 %50 %0 %0 %5 %20000405
28NC_011213AAATAT3746974871966.67 %33.33 %0 %0 %5 %20000405
29NC_011213AAT4757375831166.67 %33.33 %0 %0 %9 %20000405
30NC_011213TTAA3761876291250 %50 %0 %0 %8 %20000405
31NC_011213ATT4804180521233.33 %66.67 %0 %0 %8 %20000405
32NC_011213TATT3935093621325 %75 %0 %0 %7 %20000405
33NC_011213TTTA3961596261225 %75 %0 %0 %8 %20000405
34NC_011213ATA4998499941166.67 %33.33 %0 %0 %9 %20000405
35NC_011213ATA410085100961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %20000405
36NC_011213TTAA310223102351350 %50 %0 %0 %7 %20000405
37NC_011213AAT510274102891666.67 %33.33 %0 %0 %6 %20000405
38NC_011213ATT410425104351133.33 %66.67 %0 %0 %9 %20000405
39NC_011213TATT410744107601725 %75 %0 %0 %5 %20000405
40NC_011213TAT511694117071433.33 %66.67 %0 %0 %7 %20000405
41NC_011213A12117501176112100 %0 %0 %0 %0 %20000405
42NC_011213AATTT311898119121540 %60 %0 %0 %6 %20000405
43NC_011213TTTA312191122021225 %75 %0 %0 %8 %20000405
44NC_011213ATT412213122231133.33 %66.67 %0 %0 %9 %20000405
45NC_011213AT712324123361350 %50 %0 %0 %7 %20000405
46NC_011213ATT412504125141133.33 %66.67 %0 %0 %9 %20000405
47NC_011213TTAAAT412626126492450 %50 %0 %0 %8 %20000405
48NC_011213ATA412889129021466.67 %33.33 %0 %0 %7 %20000405
49NC_011213ATT413680136931433.33 %66.67 %0 %0 %7 %20000405
50NC_011213TA613850138611250 %50 %0 %0 %8 %20000405
51NC_011213AAAT313913139251375 %25 %0 %0 %7 %20000405
52NC_011213ACAAA313957139701480 %0 %0 %20 %7 %20000405
53NC_011213TAA414278142891266.67 %33.33 %0 %0 %8 %20000405
54NC_011213AAATT314351143641460 %40 %0 %0 %7 %20000405
55NC_011213TTA414531145421233.33 %66.67 %0 %0 %8 %20000405
56NC_011213TAT414695147061233.33 %66.67 %0 %0 %8 %20000405
57NC_011213TAA414736147461166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
58NC_011213AAGA315126151371275 %0 %25 %0 %8 %20000405
59NC_011213AAAT315815158261275 %25 %0 %0 %8 %20000405
60NC_011213ATTA315845158561250 %50 %0 %0 %8 %20000406
61NC_011213TTA415891159031333.33 %66.67 %0 %0 %7 %20000406
62NC_011213TAA415952159641366.67 %33.33 %0 %0 %7 %20000406
63NC_011213TAA416286162971266.67 %33.33 %0 %0 %8 %20000406
64NC_011213A15163971641115100 %0 %0 %0 %6 %20000406
65NC_011213TAA516409164231566.67 %33.33 %0 %0 %6 %20000406
66NC_011213ATA416433164431166.67 %33.33 %0 %0 %9 %20000406
67NC_011213ATA716514165342166.67 %33.33 %0 %0 %9 %20000406
68NC_011213ATT416656166671233.33 %66.67 %0 %0 %8 %20000406
69NC_011213AT616724167341150 %50 %0 %0 %9 %20000406
70NC_011213AT616758167681150 %50 %0 %0 %9 %20000406
71NC_011213AGTT316797168071125 %50 %25 %0 %9 %20000406
72NC_011213TAATAT316950169661750 %50 %0 %0 %5 %20000406
73NC_011213TTTAA317019170331540 %60 %0 %0 %6 %20000406
74NC_011213ATA417120171301166.67 %33.33 %0 %0 %9 %20000406
75NC_011213TAAAAA317165171821883.33 %16.67 %0 %0 %5 %20000406
76NC_011213TAA417557175681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %20000406
77NC_011213TTAT317884178951225 %75 %0 %0 %8 %20000406
78NC_011213TAA417899179101266.67 %33.33 %0 %0 %0 %20000406
79NC_011213ATTT318310183201125 %75 %0 %0 %9 %20000406
80NC_011213ATTA318474184851250 %50 %0 %0 %8 %20000406
81NC_011213TTCA318908189181125 %50 %0 %25 %9 %20000406
82NC_011213TAA418944189551266.67 %33.33 %0 %0 %8 %20000406
83NC_011213T152052820542150 %100 %0 %0 %0 %20000406
84NC_011213TAT420809208201233.33 %66.67 %0 %0 %8 %20000406
85NC_011213TAA421085210961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %20000406
86NC_011213TTA421494215041133.33 %66.67 %0 %0 %9 %20000406
87NC_011213TAT521533215461433.33 %66.67 %0 %0 %7 %20000406
88NC_011213ATA421614216241166.67 %33.33 %0 %0 %9 %20000406
89NC_011213AT621985219951150 %50 %0 %0 %9 %20000406
90NC_011213TAA422395224061266.67 %33.33 %0 %0 %8 %20000406
91NC_011213ATA522582225951466.67 %33.33 %0 %0 %7 %20000406
92NC_011213AAT422760227721366.67 %33.33 %0 %0 %7 %20000406
93NC_011213AT622910229201150 %50 %0 %0 %9 %20000406
94NC_011213AT1022928229461950 %50 %0 %0 %10 %20000406
95NC_011213TTAA323045230571350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
96NC_011213TAA424538245491266.67 %33.33 %0 %0 %8 %20000406
97NC_011213ATT424580245911233.33 %66.67 %0 %0 %8 %20000406
98NC_011213AT624693247031150 %50 %0 %0 %9 %20000406
99NC_011213TTAT324847248591325 %75 %0 %0 %7 %20000406
100NC_011213TTTA324941249521225 %75 %0 %0 %8 %20000406
101NC_011213AAAT325176251861175 %25 %0 %0 %9 %20000406
102NC_011213TATT325344253551225 %75 %0 %0 %0 %20000407
103NC_011213TTTTA325534255471420 %80 %0 %0 %7 %20000407
104NC_011213TTTA325640256511225 %75 %0 %0 %8 %20000407
105NC_011213TAT425679256891133.33 %66.67 %0 %0 %9 %20000407
106NC_011213TTGG32606226072110 %50 %50 %0 %9 %20000407
107NC_011213GCA426498265091233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %20000407
108NC_011213TTAA526613266322050 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
109NC_011213TAATA426633266511960 %40 %0 %0 %10 %Non-Coding
110NC_011213ATA426724267361366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
111NC_011213TA1226731267522250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
112NC_011213TTTA327096271061125 %75 %0 %0 %9 %20000407
113NC_011213TAAA327111271211175 %25 %0 %0 %9 %20000407
114NC_011213A16272292724416100 %0 %0 %0 %6 %20000407
115NC_011213TAAAA327286272991480 %20 %0 %0 %7 %20000407
116NC_011213TAA527573275871566.67 %33.33 %0 %0 %6 %20000407