ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Bombus ignitus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010967	TAA	5	164	179	16	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_010967	TA	13	195	220	26	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_010967	AT	13	298	321	24	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_010967	TAT	4	620	631	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	190349385
5	NC_010967	AATATT	3	672	688	17	50 %	50 %	0 %	5 %	190349385
6	NC_010967	TTA	4	987	998	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	190349385
7	NC_010967	TTA	4	1097	1109	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	190349385
8	NC_010967	ATT	4	1344	1358	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	190349385
9	NC_010967	ATTTA	4	1379	1398	20	40 %	60 %	0 %	5 %	190349385
10	NC_010967	ATTTAT	4	1454	1477	24	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_010967	AT	16	1464	1494	31	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_010967	TAT	4	1968	1979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	190349386
13	NC_010967	TAA	4	2142	2153	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	190349386
14	NC_010967	TAT	4	2259	2269	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	190349386
15	NC_010967	ATTA	3	3115	3126	12	50 %	50 %	0 %	8 %	190349386
16	NC_010967	AAAAAT	3	3170	3187	18	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	190349386
17	NC_010967	ATTCT	3	3406	3419	14	20 %	60 %	20 %	7 %	190349387
18	NC_010967	ATA	7	3450	3470	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	190349387
19	NC_010967	CAAT	3	3748	3759	12	50 %	25 %	25 %	8 %	190349387
20	NC_010967	AATT	3	3896	3907	12	50 %	50 %	0 %	8 %	190349387
21	NC_010967	AATT	3	4086	4096	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_010967	AATT	3	4370	4380	11	50 %	50 %	0 %	9 %	190349389
23	NC_010967	ATT	4	4416	4427	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	190349389
24	NC_010967	TAT	4	4538	4548	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	190349389
25	NC_010967	ATTT	3	4624	4634	11	25 %	75 %	0 %	9 %	190349389
26	NC_010967	TAT	4	4879	4890	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	190349389
27	NC_010967	AAT	4	5145	5156	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	190349390
28	NC_010967	ATT	4	5220	5232	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	190349390
29	NC_010967	AAT	4	5235	5245	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	190349390
30	NC_010967	ATTT	3	5590	5600	11	25 %	75 %	0 %	9 %	190349390
31	NC_010967	TATT	4	5753	5768	16	25 %	75 %	0 %	6 %	190349390
32	NC_010967	ATTT	3	5792	5802	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_010967	ATT	8	5922	5945	24	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	190349391
34	NC_010967	TAAA	3	5969	5980	12	75 %	25 %	0 %	8 %	190349391
35	NC_010967	ATT	4	6096	6106	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	190349391
36	NC_010967	TA	11	6140	6161	22	50 %	50 %	0 %	9 %	190349391
37	NC_010967	T	14	6166	6179	14	0 %	100 %	0 %	7 %	190349391
38	NC_010967	ATATTA	3	6233	6251	19	50 %	50 %	0 %	5 %	190349391
39	NC_010967	AT	32	6245	6305	61	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_010967	TA	21	6359	6399	41	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_010967	AT	19	6626	6662	37	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_010967	TAAA	3	6738	6749	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010967	TATT	4	6798	6813	16	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010967	AT	34	6807	6871	65	50 %	50 %	0 %	9 %	190349392
45	NC_010967	TAA	4	6912	6924	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	190349392
46	NC_010967	TAA	4	7094	7105	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	190349392
47	NC_010967	A	12	7195	7206	12	100 %	0 %	0 %	0 %	190349392
48	NC_010967	TTAAA	3	7283	7296	14	60 %	40 %	0 %	7 %	190349392
49	NC_010967	ATT	4	7308	7320	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	190349392
50	NC_010967	ATA	4	7408	7418	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	190349392
51	NC_010967	TAAT	4	7759	7774	16	50 %	50 %	0 %	6 %	190349392
52	NC_010967	TA	6	7923	7933	11	50 %	50 %	0 %	9 %	190349392
53	NC_010967	ATA	5	8147	8161	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	190349392
54	NC_010967	ATAA	3	8340	8351	12	75 %	25 %	0 %	0 %	190349392
55	NC_010967	ATAA	3	8509	8520	12	75 %	25 %	0 %	8 %	190349393
56	NC_010967	TAAATT	3	8593	8610	18	50 %	50 %	0 %	0 %	190349393
57	NC_010967	TAAA	3	8637	8648	12	75 %	25 %	0 %	0 %	190349393
58	NC_010967	TAT	4	9109	9119	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	190349393
59	NC_010967	ATTAAA	3	9118	9136	19	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	190349393
60	NC_010967	TAAA	3	9270	9285	16	75 %	25 %	0 %	6 %	190349393
61	NC_010967	A	13	9320	9332	13	100 %	0 %	0 %	0 %	190349393
62	NC_010967	AAT	4	9469	9481	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	190349393
63	NC_010967	AAT	4	9648	9659	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	190349393
64	NC_010967	TAAA	3	9709	9719	11	75 %	25 %	0 %	9 %	190349393
65	NC_010967	TAA	4	9872	9883	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	190349394
66	NC_010967	TAAA	6	9909	9930	22	75 %	25 %	0 %	9 %	190349394
67	NC_010967	TAAA	3	10007	10017	11	75 %	25 %	0 %	9 %	190349394
68	NC_010967	AATT	3	10064	10075	12	50 %	50 %	0 %	8 %	190349394
69	NC_010967	AT	28	10100	10155	56	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_010967	ATTA	3	10592	10604	13	50 %	50 %	0 %	7 %	190349395
71	NC_010967	ATTTTA	3	10637	10654	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	190349395
72	NC_010967	AAT	5	10663	10677	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	190349395
73	NC_010967	AATT	3	10684	10696	13	50 %	50 %	0 %	7 %	190349395
74	NC_010967	ATTTTA	3	10713	10730	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	190349395
75	NC_010967	AAAT	3	10735	10745	11	75 %	25 %	0 %	9 %	190349395
76	NC_010967	TAA	4	10852	10862	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	190349395
77	NC_010967	ATTT	3	11442	11452	11	25 %	75 %	0 %	9 %	190349396
78	NC_010967	AAAT	3	11823	11833	11	75 %	25 %	0 %	9 %	190349396
79	NC_010967	A	13	12012	12024	13	100 %	0 %	0 %	7 %	190349396
80	NC_010967	AT	22	12188	12230	43	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_010967	TAAA	3	12300	12311	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_010967	TAAA	4	12352	12367	16	75 %	25 %	0 %	0 %	193201814
83	NC_010967	AAT	4	12383	12394	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	193201814
84	NC_010967	AT	6	12472	12482	11	50 %	50 %	0 %	9 %	193201814
85	NC_010967	ATT	4	12779	12790	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	193201814
86	NC_010967	AAAT	3	13055	13065	11	75 %	25 %	0 %	9 %	193201814
87	NC_010967	TTA	4	13248	13260	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	193201814
88	NC_010967	TAT	4	13400	13412	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_010967	TTAA	3	13482	13492	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_010967	TAAA	3	13701	13712	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010967	TTAAA	3	13791	13804	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_010967	TA	13	14006	14030	25	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_010967	AT	9	14128	14145	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
94	NC_010967	ATTT	3	14330	14340	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_010967	ATTTTA	3	14419	14437	19	33.33 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
96	NC_010967	T	14	14734	14747	14	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_010967	TAATT	3	14848	14863	16	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_010967	ATT	5	14979	14992	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_010967	TAA	4	14999	15010	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_010967	TAT	5	15162	15175	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_010967	AAATT	3	15274	15288	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_010967	ATA	4	15461	15472	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_010967	ATT	4	15520	15532	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_010967	TAA	4	15603	15614	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010967	CATATA	4	15663	15686	24	50 %	33.33 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
106	NC_010967	TA	13	15671	15698	28	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_010967	TTTAAT	3	15885	15902	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
108	NC_010967	ATTT	4	15933	15948	16	25 %	75 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_010967	AT	32	15941	16003	63	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_010967	AAATA	3	16076	16090	15	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_010967	AATT	3	16304	16314	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_010967	TA	13	16335	16359	25	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_010967	TAT	7	16377	16397	21	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_010967	ATA	7	16403	16423	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Bombus ignitus mitochondrion