ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Igernella notabilis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010216	AAT	4	522	533	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_010216	TAAA	4	939	954	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_010216	TTAA	3	1650	1661	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_010216	AATAA	3	1738	1752	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_010216	TAA	4	1865	1875	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_010216	AAATT	3	2154	2169	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_010216	TAAA	3	2236	2246	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_010216	ATTA	3	2362	2373	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_010216	ATA	4	2747	2757	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_010216	TTAA	3	2786	2797	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_010216	TA	6	2829	2839	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_010216	ATAA	3	2950	2962	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_010216	AACG	3	3100	3110	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_010216	TTG	4	3372	3383	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_010216	ATA	4	3599	3610	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_010216	GTTA	3	3663	3675	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_010216	TGAAA	3	3828	3842	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	164421204
18	NC_010216	TAA	4	4121	4131	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	164421204
19	NC_010216	TAT	4	4411	4422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164421204
20	NC_010216	TA	6	5235	5245	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164421204
21	NC_010216	AAAT	3	5370	5382	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	164421204
22	NC_010216	TAA	5	5466	5479	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_010216	ATT	4	5492	5503	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_010216	ATT	4	5544	5554	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	164421205
25	NC_010216	GTT	4	6324	6335	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	164421205
26	NC_010216	TTAA	3	6616	6627	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_010216	TTAA	3	7475	7486	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_010216	ATT	5	7632	7646	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	164421207
29	NC_010216	TTAA	3	7834	7845	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_010216	T	12	8208	8219	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	164421208
31	NC_010216	TAT	4	8646	8657	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164421208
32	NC_010216	TAA	4	9030	9041	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164421208
33	NC_010216	AT	6	9199	9209	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164421209
34	NC_010216	TTA	4	9214	9224	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	164421209
35	NC_010216	TAA	4	9355	9366	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164421209
36	NC_010216	TTAA	3	9759	9770	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_010216	TAA	4	9868	9879	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_010216	AGTT	3	9947	9958	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	164421210
39	NC_010216	TA	6	9959	9969	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164421210
40	NC_010216	TTA	4	10308	10320	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_010216	TTA	4	10345	10356	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_010216	TTTA	3	10488	10498	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	164421211
43	NC_010216	GCA	4	10564	10575	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	164421211
44	NC_010216	TTAA	3	10739	10750	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_010216	AAAG	3	11053	11063	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	164421212
46	NC_010216	ATA	4	11084	11094	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	164421212
47	NC_010216	ATT	4	11178	11189	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164421212
48	NC_010216	GTTT	3	11596	11606	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	164421212
49	NC_010216	TAT	4	11672	11683	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_010216	TAAAA	3	11901	11915	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_010216	TAA	4	12702	12713	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164421213
52	NC_010216	ATT	4	12722	12732	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_010216	TAA	4	12736	12747	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_010216	TAA	4	12757	12768	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_010216	TTAA	3	12811	12822	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_010216	TTA	4	14255	14266	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164421214
57	NC_010216	GATT	3	14530	14541	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_010216	AAAT	3	14684	14695	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_010216	TTAA	3	14753	14764	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_010216	ATA	5	15045	15059	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	164421215
61	NC_010216	TA	6	15739	15749	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164421215
62	NC_010216	AT	6	16090	16100	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164421215
63	NC_010216	TAA	4	16234	16245	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_010216	TTAA	3	16508	16519	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_010216	TAT	4	16719	16730	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164421216
66	NC_010216	TAA	4	16871	16882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164421216
67	NC_010216	TAT	4	17258	17270	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	164421216
68	NC_010216	AT	7	17821	17834	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	164421216
69	NC_010216	TA	6	17966	17976	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164421216
70	NC_010216	TTAA	3	18200	18211	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	164421216
71	NC_010216	ATAG	3	18268	18278	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	164421216
72	NC_010216	TATT	3	18401	18412	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	164421216
73	NC_010216	TAA	4	18531	18542	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_010216	ATTA	3	18594	18605	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_010216	ATA	4	18671	18681	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Igernella notabilis mitochondrion