ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Heterorhabditis bacteriophora mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008534	TTAT	3	558	569	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	116510831
2	NC_008534	TTAATT	3	714	731	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	116510832
3	NC_008534	TATT	3	793	804	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	116510832
4	NC_008534	TTG	4	1881	1892	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	116510833
5	NC_008534	GTA	4	2344	2354	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	116510833
6	NC_008534	ATT	4	2424	2435	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	116510833
7	NC_008534	TTA	4	2931	2941	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	116510834
8	NC_008534	TTG	4	2947	2957	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	116510834
9	NC_008534	TAT	4	3647	3658	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	116510835
10	NC_008534	AATT	3	3987	3998	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	116510835
11	NC_008534	TTAA	3	4018	4029	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	116510835
12	NC_008534	TTTA	4	4063	4078	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	116510835
13	NC_008534	AAT	4	4338	4349	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	116510835
14	NC_008534	TAAA	3	4463	4474	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_008534	AGG	4	4558	4570	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_008534	AT	6	5567	5577	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	116510836
17	NC_008534	TTAG	3	5660	5671	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	116510836
18	NC_008534	ATTT	4	5727	5742	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	116510836
19	NC_008534	TTTA	3	6096	6107	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	116510836
20	NC_008534	ATT	4	6542	6552	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	116510837
21	NC_008534	TAT	4	6650	6660	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	116510837
22	NC_008534	TTTA	3	7829	7839	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_008534	ATG	4	8420	8430	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	116510838
24	NC_008534	AGG	4	8858	8870	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_008534	AT	7	9258	9270	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	116510839
26	NC_008534	TTTA	3	9328	9339	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	116510839
27	NC_008534	GGTT	3	9619	9630	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	116510839
28	NC_008534	TATT	3	9871	9881	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	116510839
29	NC_008534	TATT	3	10110	10120	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	116510839
30	NC_008534	AT	6	10186	10196	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_008534	TTTA	3	10477	10487	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	116510840
32	NC_008534	TAT	4	10630	10640	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	116510840
33	NC_008534	TATT	3	10807	10817	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	116510840
34	NC_008534	TTG	4	10953	10964	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	116510840
35	NC_008534	ATT	4	11493	11503	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	116510841
36	NC_008534	AGTT	3	11875	11885	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	116510841
37	NC_008534	TTCT	3	12018	12028	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	116510841
38	NC_008534	ATTT	3	12205	12216	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	116510841
39	NC_008534	TAATA	3	12424	12437	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_008534	TAT	5	12619	12633	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_008534	AGG	4	14252	14264	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_008534	TTTAAT	3	14442	14459	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	116510842
43	NC_008534	TATTT	5	14462	14486	25	20 %	80 %	0 %	0 %	4 %	116510842
44	NC_008534	ATT	5	14548	14561	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	116510842
45	NC_008534	TTA	5	14823	14837	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	116510842
46	NC_008534	TTTA	3	15156	15167	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	116510842
47	NC_008534	TTTATA	3	16392	16409	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
48	NC_008534	AGG	4	16476	16488	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_008534	TA	208	16647	17029	383	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_008534	AT	6	16659	16671	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_008534	AT	7	16690	16704	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_008534	TA	6	16712	16724	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_008534	TAT	4	16750	16760	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_008534	AT	16	16757	16787	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_008534	AT	8	16801	16817	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_008534	ATA	4	16819	16833	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_008534	TA	12	17032	17053	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_008534	AT	58	17194	17306	113	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_008534	AT	16	17305	17335	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_008534	TA	6	17480	17490	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_008534	TA	6	17494	17504	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_008534	AT	9	17509	17525	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_008534	TA	7	17531	17546	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_008534	TA	6	17561	17573	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_008534	TA	6	17582	17592	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_008534	AT	7	17614	17626	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_008534	GTTA	3	17787	17798	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_008534	AT	8	17825	17839	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_008534	AT	6	17843	17855	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_008534	ATA	4	17858	17868	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_008534	AT	6	17905	17915	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_008534	TA	7	17945	17959	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_008534	TTTA	4	17982	17997	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Heterorhabditis bacteriophora mitochondrion