ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Zea luxurians mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008333	GAATGG	4	31858	31881	24	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008333	AGCCAA	3	57177	57194	18	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11415160
3	NC_008333	TTCTAT	3	95496	95513	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	11415160
4	NC_008333	TCTTAT	4	100109	100132	24	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	11415160
5	NC_008333	AGGCAG	3	115978	115995	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	0 %	11415160
6	NC_008333	AGATAG	3	129158	129175	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	11415160
7	NC_008333	TATGTT	4	147438	147459	22	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	9 %	11415160
8	NC_008333	GCAGAA	4	149389	149411	23	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	8 %	11415160
9	NC_008333	AGAGAA	3	151224	151241	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	11415160
10	NC_008333	CCAGTA	3	156386	156403	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11415160
11	NC_008333	GTACTA	4	168686	168709	24	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11415160
12	NC_008333	CTACGA	3	169457	169473	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11415160
13	NC_008333	TACACA	3	170521	170538	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	11415160
14	NC_008333	CTATGC	3	170541	170557	17	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11415160
15	NC_008333	TCTCCT	3	176430	176447	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	11415160
16	NC_008333	CCATTT	4	179808	179831	24	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	8 %	11415160
17	NC_008333	TAATAG	4	179832	179855	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	4 %	11415160
18	NC_008333	AGTACT	4	181490	181519	30	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11415160
19	NC_008333	ATCTAT	4	188331	188354	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	0 %	11415160
20	NC_008333	TCTAAG	4	189211	189233	23	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	8 %	11415160
21	NC_008333	AGATAA	3	199547	199564	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	0 %	11415160
22	NC_008333	GGACAG	3	212973	212989	17	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	11415160
23	NC_008333	TCTCTG	3	218591	218607	17	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11415160
24	NC_008333	TTACCA	3	219792	219808	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	11415160
25	NC_008333	CAGATA	3	223968	223985	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11415160
26	NC_008333	TTTCTT	3	234046	234064	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	11415160
27	NC_008333	CACTTA	3	238118	238135	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	11415160
28	NC_008333	ACTTGT	3	269626	269643	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	11415160
29	NC_008333	TTCTTT	3	304279	304297	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	11415160
30	NC_008333	TAAGGA	4	330614	330637	24	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_008333	ACCCTA	4	335200	335223	24	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008333	CTATGG	3	338974	338990	17	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
33	NC_008333	CTATGA	3	350222	350238	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
34	NC_008333	TACTAA	3	357188	357206	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
35	NC_008333	CTTTAT	3	360621	360638	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008333	TATAGA	8	363594	363641	48	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_008333	TACATA	4	371986	372009	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
38	NC_008333	ACAATG	3	377820	377837	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
39	NC_008333	AGCTTT	4	386582	386605	24	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	4 %	Non-Coding
40	NC_008333	AGCTTT	3	386633	386650	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
41	NC_008333	CATTTT	3	386725	386742	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
42	NC_008333	TACTCT	4	391308	391331	24	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_008333	ATTTCT	3	393334	393351	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
44	NC_008333	TTCTGG	3	396574	396591	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008333	TTACTT	4	415607	415629	23	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
46	NC_008333	CCTTTT	3	416118	416136	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
47	NC_008333	TTCAGT	3	418210	418227	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
48	NC_008333	CTATTC	3	420410	420427	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
49	NC_008333	TATGGT	4	427537	427559	23	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	4 %	Non-Coding
50	NC_008333	ATGGAA	3	436091	436108	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008333	ATTGAA	3	436579	436597	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_008333	AAAAAG	3	438587	438605	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
53	NC_008333	GATTAT	3	444004	444020	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_008333	TTAGAT	3	465088	465105	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008333	ATGAGT	3	469326	469343	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008333	ATTACT	4	476476	476498	23	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
57	NC_008333	CTTCCT	3	477244	477262	19	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	11415162
58	NC_008333	ACCGAG	4	479090	479113	24	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_008333	CCTTAT	3	481217	481234	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008333	TCCTGT	3	489290	489306	17	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
61	NC_008333	TTAAGT	4	499739	499762	24	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_008333	GGCTAG	3	509737	509753	17	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	5 %	11415160
63	NC_008333	ATACGA	4	515691	515714	24	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
64	NC_008333	ATAAGA	4	523441	523464	24	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008333	ATAGAA	3	528060	528077	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008333	ATTCTG	3	535823	535840	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	11415161

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Zea luxurians mitochondrion