ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Zea mays subsp. parviglumis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008332CTCTA5449845222520 %40 %0 %40 %8 %Non-Coding
2NC_008332TGAAA4451845422560 %20 %20 %0 %8 %Non-Coding
3NC_008332ATTTC4525752772120 %60 %0 %20 %9 %Non-Coding
4NC_008332ACGAG3540054141540 %0 %40 %20 %0 %Non-Coding
5NC_008332TACAG3994399571540 %20 %20 %20 %6 %Non-Coding
6NC_008332GAATA312266122791460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
7NC_008332TGGAT318298183121520 %40 %40 %0 %0 %Non-Coding
8NC_008332AATTG321377213901440 %40 %20 %0 %7 %Non-Coding
9NC_008332TAACA322791228051560 %20 %0 %20 %0 %Non-Coding
10NC_008332TTAGT423465234842020 %60 %20 %0 %5 %Non-Coding
11NC_008332TAAGT534131341552540 %40 %20 %0 %0 %Non-Coding
12NC_008332TTTAG549483495072520 %60 %20 %0 %4 %Non-Coding
13NC_008332CTGAC365466654791420 %20 %20 %40 %7 %11415164
14NC_008332TTCTA366015660291520 %60 %0 %20 %0 %11415164
15NC_008332CATTT366635666491520 %60 %0 %20 %6 %11415164
16NC_008332TCCTG37209772111150 %40 %20 %40 %0 %11415164
17NC_008332AGACG376760767731440 %0 %40 %20 %7 %11415164
18NC_008332TATAT977308773514440 %60 %0 %0 %9 %11415164
19NC_008332ATGGA380946809601540 %20 %40 %0 %6 %11415164
20NC_008332ATCAA381052810661560 %20 %0 %20 %0 %11415164
21NC_008332TTAGT390438904521520 %60 %20 %0 %0 %11415164
22NC_008332CTCTA593396934202520 %40 %0 %40 %8 %11415164
23NC_008332TGAAA493416934402560 %20 %20 %0 %8 %11415164
24NC_008332ATTTC494155941752120 %60 %0 %20 %9 %11415164
25NC_008332ACGAG394298943121540 %0 %40 %20 %0 %11415164
26NC_008332AAGTC31007711007851540 %20 %20 %20 %6 %11415164
27NC_008332TTGAG31020551020691520 %40 %40 %0 %6 %11415164
28NC_008332AAAGA31051851051981480 %0 %20 %0 %7 %11415164
29NC_008332TGGAT31166461166601520 %40 %40 %0 %0 %11415163
30NC_008332ACTTT31242911243051520 %60 %0 %20 %0 %11415163
31NC_008332TCTAT31298631298761420 %60 %0 %20 %7 %11415163
32NC_008332ACTGT31313611313741420 %40 %20 %20 %7 %11415163
33NC_008332AATTC31429291429431540 %40 %0 %20 %0 %11415163
34NC_008332TACTT31489401489541520 %60 %0 %20 %0 %11415163
35NC_008332ATAGT71494641494963340 %40 %20 %0 %9 %11415163
36NC_008332AGCTT31509971510111520 %40 %20 %20 %6 %11415163
37NC_008332GTGCC3156076156090150 %20 %40 %40 %0 %11415163
38NC_008332ACCTT41577201577392020 %40 %0 %40 %0 %11415163
39NC_008332TAACT41602381602572040 %40 %0 %20 %5 %11415163
40NC_008332AAAGT31649231649361460 %20 %20 %0 %7 %11415163
41NC_008332TCATA61706201706493040 %40 %0 %20 %0 %11415163
42NC_008332CTTTT3187481187495150 %80 %0 %20 %6 %11415163
43NC_008332TAAAG41885111885302060 %20 %20 %0 %10 %11415163
44NC_008332CTACA31951841951981540 %20 %0 %40 %0 %11415163
45NC_008332AAATG31995271995411560 %20 %20 %0 %6 %11415163
46NC_008332TTCTT3203630203644150 %80 %0 %20 %0 %11415163
47NC_008332TGCGT3204855204868140 %40 %40 %20 %7 %11415163
48NC_008332TTAAG32141522141661540 %40 %20 %0 %0 %11415163
49NC_008332ATCTT52236702236942520 %60 %0 %20 %0 %11415163
50NC_008332AGAAA32277022277151480 %0 %20 %0 %7 %11415163
51NC_008332TACTA72301872302223640 %40 %0 %20 %8 %11415163
52NC_008332CAGTA32311042311171440 %20 %20 %20 %7 %11415163
53NC_008332CTGAT32346402346541520 %40 %20 %20 %6 %11415163
54NC_008332ACTTT32468802468941520 %60 %0 %20 %0 %11415163
55NC_008332GGTAA32559212559361640 %20 %40 %0 %6 %11415163
56NC_008332TCACT32651902652041520 %40 %0 %40 %6 %11415163
57NC_008332GCAAA32707502707641560 %0 %20 %20 %0 %11415163
58NC_008332CTATA32843562843701540 %40 %0 %20 %0 %11415163
59NC_008332TAAGT72871192871513340 %40 %20 %0 %9 %11415163
60NC_008332TGGAT32900452900591520 %40 %40 %0 %0 %11415163
61NC_008332CTATA32908352908491540 %40 %0 %20 %0 %11415163
62NC_008332TCAAA32972482972621560 %20 %0 %20 %0 %11415163
63NC_008332CTTTA32981802981941520 %60 %0 %20 %0 %11415163
64NC_008332CTATA42996802996992040 %40 %0 %20 %5 %11415163
65NC_008332GAAAT33001563001701560 %20 %20 %0 %0 %11415163
66NC_008332ACTAA43017173017362060 %20 %0 %20 %5 %11415163
67NC_008332TACTA53024263024502540 %40 %0 %20 %8 %11415163
68NC_008332TATAG33223163223301540 %40 %20 %0 %0 %11415163
69NC_008332ACTAA33317913318051560 %20 %0 %20 %0 %11415163
70NC_008332CTATA33327783327921540 %40 %0 %20 %0 %11415163
71NC_008332AAAAC33338393338531580 %0 %0 %20 %6 %11415163
72NC_008332AACTT33350203350341540 %40 %0 %20 %6 %11415163
73NC_008332GGCAA33368043368181540 %0 %40 %20 %6 %11415163
74NC_008332AGGCA33371053371191540 %0 %40 %20 %6 %11415163
75NC_008332GAAAG33396343396481560 %0 %40 %0 %0 %11415163
76NC_008332ATAGG33422243422381540 %20 %40 %0 %6 %11415163
77NC_008332CTTTG3346130346143140 %60 %20 %20 %7 %11415163
78NC_008332TCCTT3350039350053150 %60 %0 %40 %6 %11415163
79NC_008332ATACG33514373514501440 %20 %20 %20 %7 %11415163
80NC_008332TCTAT43600173600372120 %60 %0 %20 %9 %11415163
81NC_008332TATAG53642663642902540 %40 %20 %0 %8 %11415163
82NC_008332CCTGG3364997365011150 %20 %40 %40 %0 %11415163
83NC_008332ATAGT53756813757042440 %40 %20 %0 %4 %11415163
84NC_008332GAATA33797813797941460 %20 %20 %0 %7 %11415163
85NC_008332GAATA33797983798111460 %20 %20 %0 %7 %11415163
86NC_008332ATTCC33799423799561520 %40 %0 %40 %0 %11415163
87NC_008332TCCAC33816393816531520 %20 %0 %60 %6 %11415163
88NC_008332TATAG33950153950291540 %40 %20 %0 %0 %11415163
89NC_008332GTAAA53960143960382560 %20 %20 %0 %0 %11415163
90NC_008332ACTTG43970863971062120 %40 %20 %20 %4 %11415163
91NC_008332CTCCA33995323995461520 %20 %0 %60 %0 %11415163
92NC_008332TCGCT3401307401321150 %40 %20 %40 %6 %11415163
93NC_008332TTAGT74051144051483520 %60 %20 %0 %8 %11415163
94NC_008332ATAGG124073394073965840 %20 %40 %0 %5 %11415163
95NC_008332AAGTA34074484074611460 %20 %20 %0 %7 %11415163
96NC_008332ATAGT64115064115353040 %40 %20 %0 %6 %11415163
97NC_008332TCGGT3417963417977150 %40 %40 %20 %6 %11415163
98NC_008332GTTAG34252444252581520 %40 %40 %0 %0 %11415163
99NC_008332GGCAA34320204320331440 %0 %40 %20 %7 %11415163
100NC_008332GTAAA34324604324741560 %20 %20 %0 %0 %11415163
101NC_008332TGAAA34404974405101460 %20 %20 %0 %7 %11415163
102NC_008332TCAAA34439014439151560 %20 %0 %20 %0 %11415163
103NC_008332CTTTA34448334448471520 %60 %0 %20 %0 %11415163
104NC_008332CTATA44463334463522040 %40 %0 %20 %5 %11415163
105NC_008332GAAAT34468094468231560 %20 %20 %0 %0 %11415163
106NC_008332ACTAA44483704483892060 %20 %0 %20 %5 %11415163
107NC_008332TACTA54490794491032540 %40 %0 %20 %8 %11415163
108NC_008332TATAG34689694689831540 %40 %20 %0 %0 %11415163
109NC_008332ACTAA34784444784581560 %20 %0 %20 %0 %11415163
110NC_008332CTATA34794314794451540 %40 %0 %20 %0 %11415163
111NC_008332AAAAC34804924805061580 %0 %0 %20 %6 %11415163
112NC_008332AACTT34816734816871540 %40 %0 %20 %6 %11415163
113NC_008332GGCAA34834574834711540 %0 %40 %20 %6 %11415163
114NC_008332AGGCA34837584837721540 %0 %40 %20 %6 %11415163
115NC_008332GAAAG34862874863011560 %0 %40 %0 %0 %11415163
116NC_008332ATAGG34888774888911540 %20 %40 %0 %6 %11415163
117NC_008332TTGAA34944574944711540 %40 %20 %0 %0 %11415163
118NC_008332TGATT34951084951231620 %60 %20 %0 %6 %11415163
119NC_008332TTCCT3501099501113150 %60 %0 %40 %6 %11415163
120NC_008332TCTAC35022505022641520 %40 %0 %40 %0 %11415163
121NC_008332CAGAG35030625030751440 %0 %40 %20 %7 %11415163
122NC_008332TAGTA55099985100222540 %40 %20 %0 %8 %11415163
123NC_008332GCAGG45102045102232020 %0 %60 %20 %0 %11415163
124NC_008332GGGAA95151915152354540 %0 %60 %0 %4 %11415163
125NC_008332CTACG35196545196681520 %20 %20 %40 %0 %11415163
126NC_008332TTTCA35229805229931420 %60 %0 %20 %7 %11415163
127NC_008332TTTAC35310165310301520 %60 %0 %20 %0 %11415163
128NC_008332TTGCC3531457531470140 %40 %20 %40 %7 %11415163
129NC_008332CTAAC35382325382461540 %20 %0 %40 %0 %11415163
130NC_008332TACTA65519595519883040 %40 %0 %20 %6 %11415163
131NC_008332CCTAT125560945561515820 %40 %0 %40 %5 %11415163
132NC_008332TACTA95583315583754540 %40 %0 %20 %6 %11415163
133NC_008332TGGAG35639445639581520 %20 %60 %0 %0 %11415163
134NC_008332CTTTA65674515674803020 %60 %0 %20 %6 %11415163
135NC_008332CTATA35684615684751540 %40 %0 %20 %0 %11415163
136NC_008332CCTTT4568693568713210 %60 %0 %40 %9 %11415163
137NC_008332ATTCC35758085758211420 %40 %0 %40 %7 %11415163
138NC_008332ACTAT55804525804752440 %40 %0 %20 %8 %11415163
139NC_008332TATAG35806015806151540 %40 %20 %0 %0 %11415163
140NC_008332CCTTT3581989582003150 %60 %0 %40 %0 %11415163
141NC_008332CTTTT3583953583967150 %80 %0 %20 %6 %11415163
142NC_008332TAAAG45849835850022060 %20 %20 %0 %10 %11415163
143NC_008332CTACA35916565916701540 %20 %0 %40 %0 %11415163
144NC_008332AAATG35959995960131560 %20 %20 %0 %6 %11415163
145NC_008332TAATA36098966099101560 %40 %0 %0 %0 %11415163
146NC_008332AAAGT36105406105541560 %20 %20 %0 %0 %11415163
147NC_008332CGGGG3615292615306150 %0 %80 %20 %0 %11415163
148NC_008332CATCT36340236340361420 %40 %0 %40 %7 %11415164
149NC_008332CTTTT4634944634962190 %80 %0 %20 %5 %11415164
150NC_008332ATAGG56361946362182540 %20 %40 %0 %0 %11415164
151NC_008332ATCCC36396836396961420 %20 %0 %60 %7 %11415164
152NC_008332CGGCC3640243640257150 %0 %40 %60 %0 %11415164
153NC_008332GAAGT36516536516671540 %20 %40 %0 %6 %11415164
154NC_008332GATAT36528546528681540 %40 %20 %0 %0 %11415164
155NC_008332ATACT36530936531071540 %40 %0 %20 %0 %11415164
156NC_008332CTTAA36540526540661540 %40 %0 %20 %6 %11415164
157NC_008332TACTA36563116563251540 %40 %0 %20 %0 %11415164
158NC_008332TATGA46563576563751940 %40 %20 %0 %5 %11415164
159NC_008332GAATA36583326583471660 %20 %20 %0 %6 %11415164
160NC_008332AAGTA56603236603462460 %20 %20 %0 %8 %11415164
161NC_008332AGAAA36624766624891480 %0 %20 %0 %7 %11415164