ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Zea perennis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008331ATG4199720081233.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %11415156
2NC_008331GTT425462557120 %66.67 %33.33 %0 %8 %11415156
3NC_008331TTC451425153120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
4NC_008331ATT4714571551133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_008331CTT490369046110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
6NC_008331TAG4941894291233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
7NC_008331TCA412803128141233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11415157
8NC_008331TAC414384143941133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
9NC_008331ATC415919159291133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
10NC_008331GAA416003160141266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
11NC_008331AAT416396164081366.67 %33.33 %0 %0 %7 %11415157
12NC_008331TAA418221182311166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11415157
13NC_008331GTT42081320824120 %66.67 %33.33 %0 %8 %11415157
14NC_008331AGA422887228981266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
15NC_008331TAC426518265291233.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %11415157
16NC_008331ATG427913279241233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11415157
17NC_008331AAT429847298571166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11415157
18NC_008331TAT432538325481133.33 %66.67 %0 %0 %9 %11415157
19NC_008331AGT1233030330653633.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %11415157
20NC_008331TCT53559535610160 %66.67 %0 %33.33 %6 %11415157
21NC_008331TTC43754637557120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
22NC_008331AGA441307413171166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
23NC_008331AGT544144441581533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %11415157
24NC_008331TTC44502045031120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
25NC_008331TAT446038460491233.33 %66.67 %0 %0 %8 %11415157
26NC_008331AGA448698487081166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
27NC_008331TAA449550495601166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11415157
28NC_008331ACT451733517431133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
29NC_008331GTC45245652467120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
30NC_008331CGT45772357734120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
31NC_008331GTT45807458084110 %66.67 %33.33 %0 %9 %11415157
32NC_008331AAG460167601791366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
33NC_008331ATA460638606481166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11415157
34NC_008331AGT463857638681233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11415157
35NC_008331TCT46448864499120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
36NC_008331AAT464788647981166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11415157
37NC_008331CTA468262682741333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %11415157
38NC_008331CTT47340773417110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11415157
39NC_008331TCT57393073943140 %66.67 %0 %33.33 %7 %11415157
40NC_008331GAT577004770181533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %11415157
41NC_008331GCT47833978350120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
42NC_008331TTC48343683447120 %66.67 %0 %33.33 %0 %11415157
43NC_008331AGA488863888741266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
44NC_008331CTT49448394494120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
45NC_008331AAG497773977841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
46NC_008331ATT51000781000921533.33 %66.67 %0 %0 %6 %11415157
47NC_008331GAA41027721027831266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
48NC_008331CTA41049711049811133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
49NC_008331TCC4105607105618120 %33.33 %0 %66.67 %8 %11415157
50NC_008331ATC41067951068051133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
51NC_008331AGA41106941107051266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
52NC_008331AGA41124111124231366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
53NC_008331ACC41146591146711333.33 %0 %0 %66.67 %7 %11415157
54NC_008331CTC4117544117554110 %33.33 %0 %66.67 %9 %11415157
55NC_008331TCC4117853117864120 %33.33 %0 %66.67 %8 %11415157
56NC_008331AAG41223431223531166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
57NC_008331TCC4123299123309110 %33.33 %0 %66.67 %9 %11415157
58NC_008331ACT41296561296661133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
59NC_008331CCT4129861129872120 %33.33 %0 %66.67 %8 %11415157
60NC_008331AAC41305871305981266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11415157
61NC_008331AAG41310721310821166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
62NC_008331GAG41335571335671133.33 %0 %66.67 %0 %9 %11415157
63NC_008331ATC41397461397561133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
64NC_008331AGA41410731410841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
65NC_008331GAT41420221420321133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11415157
66NC_008331GTC4142489142500120 %33.33 %33.33 %33.33 %0 %11415157
67NC_008331AGA41502461502561166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
68NC_008331TAC41503141503241133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
69NC_008331CCG4151302151313120 %0 %33.33 %66.67 %8 %11415157
70NC_008331ACA41525181525291266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11415157
71NC_008331TCT4154586154597120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
72NC_008331TTC4156928156940130 %66.67 %0 %33.33 %7 %11415157
73NC_008331TCG4160475160485110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11415157
74NC_008331AAT41605941606041166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11415157
75NC_008331TAG41624861624971233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11415157
76NC_008331AAG41631081631181166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
77NC_008331AAT41635771635891366.67 %33.33 %0 %0 %7 %11415157
78NC_008331CCT4172234172245120 %33.33 %0 %66.67 %8 %11415157
79NC_008331CAA41795881795991266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11415157
80NC_008331TTC4183900183910110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11415157
81NC_008331GAT41853511853611133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11415157
82NC_008331AGA41880201880321366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
83NC_008331ACA41886711886821266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11415157
84NC_008331TCT4188974188984110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11415157
85NC_008331ATC41907011907121233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11415157
86NC_008331GAA41933361933481366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
87NC_008331ACT41968731968851333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %11415157
88NC_008331TGC4197784197795120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
89NC_008331TAG42035002035121333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %11415157
90NC_008331CTT4206026206036110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11415157
91NC_008331TCC4208611208622120 %33.33 %0 %66.67 %8 %11415157
92NC_008331ACA42133592133701266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11415157
93NC_008331AAC42190722190841366.67 %0 %0 %33.33 %7 %11415157
94NC_008331TCT4219109219120120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
95NC_008331TGT4225435225446120 %66.67 %33.33 %0 %8 %11415157
96NC_008331GAT42275322275431233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11415157
97NC_008331TAA42284982285091266.67 %33.33 %0 %0 %8 %11415157
98NC_008331TGC4234650234661120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
99NC_008331GAA42347082347191266.67 %0 %33.33 %0 %0 %11415157
100NC_008331CGT4234843234853110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11415157
101NC_008331AGC42398052398161233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %11415157
102NC_008331ATA42410292410401266.67 %33.33 %0 %0 %8 %11415157
103NC_008331ATC52411372411511533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %11415157
104NC_008331AAG42442112442241466.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
105NC_008331TAA42514252514361266.67 %33.33 %0 %0 %8 %11415157
106NC_008331GTT4257379257389110 %66.67 %33.33 %0 %9 %11415157
107NC_008331GAG42577022577121133.33 %0 %66.67 %0 %9 %11415157
108NC_008331TGT4260411260422120 %66.67 %33.33 %0 %8 %11415157
109NC_008331AGA42644372644491366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
110NC_008331ACA42655562655671266.67 %0 %0 %33.33 %0 %11415157
111NC_008331GAA42668342668441166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
112NC_008331TCT5267684267698150 %66.67 %0 %33.33 %6 %11415157
113NC_008331CTA42696992697101233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11415157
114NC_008331CTG4270289270300120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
115NC_008331TTC4271711271723130 %66.67 %0 %33.33 %7 %11415157
116NC_008331GAA42719032719131166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
117NC_008331ACT42733182733301333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %11415157
118NC_008331CTA42746152746261233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11415157
119NC_008331TAC42748972749071133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
120NC_008331GGC4281665281676120 %0 %66.67 %33.33 %8 %11415157
121NC_008331GAA42834872834971166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
122NC_008331CTG4287324287335120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
123NC_008331CTT4291897291908120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
124NC_008331CTT4294819294830120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
125NC_008331GCT4295104295115120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
126NC_008331AAG42961982962091266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
127NC_008331TCT4297224297236130 %66.67 %0 %33.33 %7 %11415157
128NC_008331CTT4297720297730110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11415157
129NC_008331CTA52982612982751533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %11415157
130NC_008331AGT42985902986011233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11415157
131NC_008331TAG43057943058051233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11415157
132NC_008331TAG43095783095891233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11415157
133NC_008331ATA43124693124791166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11415157
134NC_008331CTT4312542312553120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
135NC_008331TAT43130633130731133.33 %66.67 %0 %0 %9 %11415157
136NC_008331CTT4318989318999110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11415157
137NC_008331AGA43202683202781166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
138NC_008331CTT4320472320483120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
139NC_008331CGT4323953323963110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11415157
140NC_008331GAT43240873240971133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11415157
141NC_008331TTA43250513250611133.33 %66.67 %0 %0 %9 %11415157
142NC_008331GTA43341883341991233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11415157
143NC_008331AGT53465183465311433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %11415157
144NC_008331GAA43482983483081166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
145NC_008331AGA53535853535981466.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
146NC_008331CAG43557583557691233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %11415157
147NC_008331ATG43574613574721233.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %11415157
148NC_008331GTT4358010358021120 %66.67 %33.33 %0 %8 %11415157
149NC_008331TTC4360606360617120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
150NC_008331ATT43626093626191133.33 %66.67 %0 %0 %9 %11415157
151NC_008331AGA43645033645141266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
152NC_008331TCT4365877365888120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
153NC_008331ATA43682123682241366.67 %33.33 %0 %0 %7 %11415157
154NC_008331AAG43759643759751266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
155NC_008331AGA43777393777491166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
156NC_008331AGG43782553782651133.33 %0 %66.67 %0 %9 %11415157
157NC_008331ACG43802033802141233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %11415157
158NC_008331CTT4382329382340120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
159NC_008331TAT43840473840581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %11415157
160NC_008331GCA43841713841811133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %11415157
161NC_008331AAG43847583847691266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
162NC_008331ATT43909363909461133.33 %66.67 %0 %0 %9 %11415157
163NC_008331TCT4393721393731110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11415157
164NC_008331GAA43949703949801166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
165NC_008331GAA43964773964891366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
166NC_008331TAC43968363968461133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
167NC_008331AGC43991773991891333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %11415157
168NC_008331TTA44002174002281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %11415157
169NC_008331AAG44015824015921166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
170NC_008331TCT4404028404039120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
171NC_008331ATA54106524106651466.67 %33.33 %0 %0 %7 %11415157
172NC_008331ATT54106804106941533.33 %66.67 %0 %0 %6 %11415157
173NC_008331GAA44132774132871166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
174NC_008331GAA44138404138511266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
175NC_008331TTC4414216414227120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
176NC_008331TCT4415332415342110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
177NC_008331CTT4425083425093110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
178NC_008331AGA44263624263721166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
179NC_008331CTT4426566426577120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
180NC_008331CGT4430047430057110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
181NC_008331GAT44301814301911133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
182NC_008331TTA44311454311551133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
183NC_008331CTT4433984433995120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
184NC_008331GTA44360224360321133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11415157
185NC_008331AGA44372754372861266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
186NC_008331CAT44445294445391133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
187NC_008331AGT44453514453631333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %11415157
188NC_008331TCT4445376445387120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
189NC_008331TTC4445730445741120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
190NC_008331CTT4448848448860130 %66.67 %0 %33.33 %7 %11415157
191NC_008331TTC4448901448912120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
192NC_008331ATC44503474503571133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
193NC_008331GTC4453899453910120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
194NC_008331GAA44553044553151266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11415157
195NC_008331AAG44568614568711166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11415157
196NC_008331CTA44642884642991233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11415157
197NC_008331CTT4464919464929110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11415157
198NC_008331TGT4465084465096130 %66.67 %33.33 %0 %7 %11415157
199NC_008331CAT44658764658861133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11415157
200NC_008331GCC4467235467245110 %0 %33.33 %66.67 %9 %11415157
201NC_008331ACC44679504679621333.33 %0 %0 %66.67 %7 %11415157
202NC_008331CAG44687324687431233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %11415157
203NC_008331TTG4469155469166120 %66.67 %33.33 %0 %8 %11415157
204NC_008331TTG4470883470893110 %66.67 %33.33 %0 %9 %11415157
205NC_008331CAA44772984773081166.67 %0 %0 %33.33 %9 %11415157
206NC_008331CCA44811694811791133.33 %0 %0 %66.67 %9 %11415157
207NC_008331TTC4485145485156120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
208NC_008331TCT8485161485183230 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
209NC_008331AAC44852484852591266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11415157
210NC_008331CTT4485259485270120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
211NC_008331CCT4485271485282120 %33.33 %0 %66.67 %8 %11415157
212NC_008331CCA44898264898371233.33 %0 %0 %66.67 %8 %11415157
213NC_008331GAA44959244959361366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
214NC_008331CTG4496579496589110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11415157
215NC_008331TAC44975694975801233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11415157
216NC_008331TTC4499563499574120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11415157
217NC_008331ACT55034035034171533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %11415157
218NC_008331TAG55037405037541533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %11415157
219NC_008331AGC45067835067941233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %11415157
220NC_008331CCT4508915508926120 %33.33 %0 %66.67 %8 %11415157
221NC_008331GAA45107495107611366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
222NC_008331CAA45118985119091266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11415157
223NC_008331CTC4516030516041120 %33.33 %0 %66.67 %0 %11415157
224NC_008331ATT45193785193881133.33 %66.67 %0 %0 %9 %11415157
225NC_008331GTT4520483520494120 %66.67 %33.33 %0 %8 %11415157
226NC_008331CTT5522549522562140 %66.67 %0 %33.33 %7 %11415157
227NC_008331CAG45234675234781233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %11415157
228NC_008331TGC4523776523786110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11415157
229NC_008331ACT45253675253781233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11415157
230NC_008331TGC4526095526105110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11415157
231NC_008331GAA45321495321611366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11415157
232NC_008331TAA45325505325611266.67 %33.33 %0 %0 %8 %11415157
233NC_008331TAA55338025338161566.67 %33.33 %0 %0 %6 %11415157
234NC_008331GCC4535203535213110 %0 %33.33 %66.67 %9 %11415157
235NC_008331CAG45364855364951133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %11415157
236NC_008331ACC45365875365981233.33 %0 %0 %66.67 %0 %11415157
237NC_008331TGC4543033543044120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11415157
238NC_008331CTT4543353543364120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
239NC_008331ACG45443725443831233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
240NC_008331ACT45448215448311133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
241NC_008331TCT4545253545263110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
242NC_008331TGC4552560552571120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
243NC_008331GAA45526185526291266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
244NC_008331CGT4552753552763110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
245NC_008331AGC45577155577261233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
246NC_008331ATA45589395589501266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
247NC_008331ATC55590475590611533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
248NC_008331TCT4563857563867110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding