ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Zea perennis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008331	AG	7	104	116	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008331	AT	6	8852	8863	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008331	GA	6	23969	23979	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
4	NC_008331	AT	7	41356	41369	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
5	NC_008331	TA	7	46081	46093	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
6	NC_008331	AT	7	49938	49950	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
7	NC_008331	AT	6	51481	51491	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415157
8	NC_008331	AT	7	63380	63393	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
9	NC_008331	TA	7	67583	67596	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
10	NC_008331	AT	6	68794	68805	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415157
11	NC_008331	TC	8	78933	78947	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	11415157
12	NC_008331	CT	6	86173	86184	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415157
13	NC_008331	TC	6	120799	120809	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
14	NC_008331	TC	6	126605	126616	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415157
15	NC_008331	TA	6	134840	134851	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415157
16	NC_008331	TG	8	135348	135363	16	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	11415157
17	NC_008331	GA	6	138585	138595	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
18	NC_008331	TC	6	138650	138660	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
19	NC_008331	GA	6	142903	142913	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
20	NC_008331	CT	7	143015	143028	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415157
21	NC_008331	CT	7	146329	146341	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415157
22	NC_008331	TC	6	151562	151572	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
23	NC_008331	AG	6	156152	156163	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
24	NC_008331	AT	8	157363	157377	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11415157
25	NC_008331	GA	6	158648	158658	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
26	NC_008331	AT	6	187067	187077	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415157
27	NC_008331	CT	7	188356	188368	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415157
28	NC_008331	AC	6	188801	188811	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11415157
29	NC_008331	GA	7	190172	190185	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415157
30	NC_008331	CA	6	197166	197176	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11415157
31	NC_008331	GA	6	214475	214485	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
32	NC_008331	TA	7	215479	215492	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
33	NC_008331	CT	6	217842	217855	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415157
34	NC_008331	TC	6	223189	223199	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
35	NC_008331	AT	7	231515	231528	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
36	NC_008331	AG	6	231929	231940	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
37	NC_008331	AG	6	239212	239223	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
38	NC_008331	GA	6	243124	243135	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
39	NC_008331	CT	6	266223	266233	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
40	NC_008331	TC	6	268809	268820	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415157
41	NC_008331	CT	6	280359	280369	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
42	NC_008331	AT	7	286622	286635	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
43	NC_008331	AG	6	288052	288063	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
44	NC_008331	TC	6	295961	295971	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
45	NC_008331	AT	6	313167	313177	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415157
46	NC_008331	AG	6	316411	316421	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
47	NC_008331	AT	6	333239	333250	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415157
48	NC_008331	GA	6	341244	341254	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
49	NC_008331	AT	6	383013	383023	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415157
50	NC_008331	GA	6	386949	386959	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
51	NC_008331	CT	6	397368	397378	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
52	NC_008331	AG	6	398321	398332	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
53	NC_008331	AT	6	410669	410679	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415157
54	NC_008331	GA	7	420411	420424	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_008331	AG	6	422505	422515	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_008331	AT	6	438475	438485	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415157
57	NC_008331	AG	8	438600	438614	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	11415157
58	NC_008331	AT	7	447970	447982	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
59	NC_008331	AG	6	452265	452275	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
60	NC_008331	TA	9	458633	458649	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11415157
61	NC_008331	TC	6	467632	467643	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415157
62	NC_008331	TA	6	468406	468416	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415157
63	NC_008331	TA	7	482141	482154	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
64	NC_008331	TA	7	482168	482180	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415157
65	NC_008331	CT	6	485622	485633	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415157
66	NC_008331	TG	7	487870	487882	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	11415157
67	NC_008331	CT	6	495855	495865	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
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69	NC_008331	AG	7	507692	507705	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415157
70	NC_008331	AG	6	523086	523097	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
71	NC_008331	GA	6	533947	533957	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
72	NC_008331	CT	6	543915	543925	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_008331	AG	6	557122	557133	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Zea perennis mitochondrion