ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Vanhornia eucnemidarum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008323	ATT	5	310	323	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	114052841
2	NC_008323	ATATTA	3	400	417	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	114052841
3	NC_008323	TTTTAA	3	544	562	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	114052841
4	NC_008323	TAAT	3	856	868	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	114052841
5	NC_008323	TTTATA	3	1119	1136	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	114052841
6	NC_008323	GGA	4	2018	2028	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	114052842
7	NC_008323	CAA	4	2268	2279	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	114052842
8	NC_008323	AAAT	3	2340	2350	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	114052842
9	NC_008323	ATT	4	3154	3165	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	114052843
10	NC_008323	TAA	4	3168	3178	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	114052843
11	NC_008323	ATTC	3	3508	3519	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	114052843
12	NC_008323	ATT	4	3680	3690	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	114052843
13	NC_008323	ATTT	3	4068	4079	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008323	TTAA	3	4408	4419	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_008323	TAA	4	4554	4566	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_008323	ATTA	3	4741	4752	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_008323	AAT	4	4901	4912	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	114052844
18	NC_008323	TA	6	5242	5253	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	114052845
19	NC_008323	TA	6	5288	5299	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	114052845
20	NC_008323	ATT	5	5492	5505	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	114052845
21	NC_008323	ATTA	3	5617	5628	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	114052846
22	NC_008323	TAAA	3	6412	6427	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_008323	TAAA	3	6449	6460	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008323	TAA	4	6887	6897	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_008323	ATA	10	8200	8230	31	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_008323	ATT	4	8242	8253	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_008323	ATTAA	3	8294	8313	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_008323	TAT	4	8338	8350	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_008323	AATT	3	8628	8639	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	114052848
30	NC_008323	ATTT	3	8686	8696	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	114052848
31	NC_008323	ATA	5	8764	8777	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	114052848
32	NC_008323	AAATA	4	9000	9020	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	114052848
33	NC_008323	TAAA	3	9220	9230	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	114052848
34	NC_008323	ACA	4	9287	9297	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	114052848
35	NC_008323	TAAA	3	9624	9634	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	114052848
36	NC_008323	A	25	10088	10112	25	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	114052848
37	NC_008323	ATA	4	10119	10129	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	114052848
38	NC_008323	AAAT	3	10202	10213	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	114052849
39	NC_008323	A	12	10359	10370	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	114052849
40	NC_008323	TAAA	3	10409	10420	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	114052849
41	NC_008323	TTA	5	10810	10824	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	114052849
42	NC_008323	CAAA	3	10952	10963	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	114052849
43	NC_008323	AAAT	3	10974	10984	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	114052849
44	NC_008323	AT	7	11254	11267	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	114052849
45	NC_008323	TA	6	11372	11383	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	114052849
46	NC_008323	ATA	4	11651	11662	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	114052850
47	NC_008323	TA	6	11688	11698	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	114052850
48	NC_008323	TA	6	11754	11765	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	114052850
49	NC_008323	AGAA	3	11870	11880	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_008323	AAT	5	12257	12271	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	114052851
51	NC_008323	AATTT	3	12293	12306	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	114052851
52	NC_008323	AT	11	12393	12414	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_008323	TAT	4	13221	13231	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	114052852
54	NC_008323	ATA	4	13456	13466	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	114052852
55	NC_008323	TAT	4	13608	13618	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	114052852
56	NC_008323	AAT	7	13796	13815	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	114052853
57	NC_008323	TA	6	13847	13857	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	114052853
58	NC_008323	AT	6	14193	14203	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	114052853
59	NC_008323	AT	8	14406	14420	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	114052853
60	NC_008323	TATTAA	3	14423	14440	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	114052853
61	NC_008323	CCAAAA	3	14665	14682	18	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	5 %	114052853
62	NC_008323	AAAAT	3	15176	15191	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_008323	TAAT	3	15445	15456	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_008323	TAAA	3	15741	15752	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008323	AATTC	3	15765	15779	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
66	NC_008323	TAA	4	16090	16102	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_008323	TAAAT	3	16329	16343	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008323	AT	6	16424	16435	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Vanhornia eucnemidarum mitochondrion