ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Zea mays subsp. mays mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007982	ATAAGG	3	16556	16573	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007982	CTCTCG	4	18696	18719	24	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	4 %	94502579
3	NC_007982	AGGAAG	3	20566	20584	19	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	94502571
4	NC_007982	ATGAGT	3	34566	34583	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007982	GGCTAG	3	81090	81106	17	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	5 %	94502719
6	NC_007982	ATACGA	4	87036	87059	24	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	8 %	94502719
7	NC_007982	AATAGG	3	89535	89551	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	94502719
8	NC_007982	ATAAGA	4	94794	94817	24	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	0 %	94502719
9	NC_007982	ATAGAA	3	99389	99406	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	0 %	94502719
10	NC_007982	AGAAAA	3	109213	109231	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	94502719
11	NC_007982	TTAGAT	3	132492	132509	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	0 %	94502719
12	NC_007982	ATTTGG	3	148333	148350	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	94502719
13	NC_007982	GAATGG	4	182063	182086	24	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	8 %	94502722
14	NC_007982	CGTAAA	3	257590	257608	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	94502722
15	NC_007982	AAAGAA	3	259356	259374	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	94502722
16	NC_007982	ATACTA	4	265067	265090	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	94502722
17	NC_007982	TCTTTA	3	265891	265908	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	94502722
18	NC_007982	ACTTAG	4	276287	276309	23	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	8 %	94502722
19	NC_007982	TATAGA	3	277179	277196	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	0 %	94502722
20	NC_007982	GGGAGA	3	278080	278098	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	94502722
21	NC_007982	AGTACT	3	284076	284093	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502722
22	NC_007982	TATTAC	4	285759	285782	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	0 %	94502722
23	NC_007982	ATGGAA	5	285784	285813	30	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	3 %	94502722
24	NC_007982	AGGAGA	3	289194	289211	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	94502722
25	NC_007982	GCATAG	3	295123	295139	17	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	94502722
26	NC_007982	TCGTAG	3	296202	296218	17	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	94502722
27	NC_007982	GTACTA	3	296981	296998	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502722
28	NC_007982	CTATGG	3	301446	301462	17	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	94502722
29	NC_007982	TTTCAC	3	305636	305653	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	0 %	94502722
30	NC_007982	TTTCTT	3	311984	312002	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	94502722
31	NC_007982	CACTTA	3	316107	316124	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	94502722
32	NC_007982	ATAAGC	3	328003	328020	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	94502722
33	NC_007982	TCTTCA	3	337978	337995	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	94502722
34	NC_007982	TATATT	3	348786	348803	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	94502722
35	NC_007982	AGCTTT	4	363039	363062	24	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	4 %	94502722
36	NC_007982	AGCTTT	3	363090	363107	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	94502722
37	NC_007982	CATTTT	3	363189	363206	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	94502722
38	NC_007982	TACTCT	4	367877	367900	24	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	8 %	94502722
39	NC_007982	ATTTCT	3	369929	369946	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	94502722
40	NC_007982	TTCTGG	3	373230	373247	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94502722
41	NC_007982	TTCTTT	3	386330	386348	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	94502722
42	NC_007982	TTCAAT	3	388340	388358	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	94502722
43	NC_007982	TTCCAT	3	388839	388856	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	0 %	94502722
44	NC_007982	ATGGCA	4	393985	394007	23	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	8 %	94502722
45	NC_007982	ACCATA	7	397492	397532	41	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	9 %	94502722
46	NC_007982	TTAGTT	3	400006	400023	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	94502722
47	NC_007982	ACTGAA	3	407007	407024	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	94502722
48	NC_007982	AAAGTA	4	409625	409649	25	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	8 %	94502722
49	NC_007982	CCATTG	3	419951	419968	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	94502722
50	NC_007982	AATGAA	4	423863	423886	24	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	8 %	94502722
51	NC_007982	TATCTA	9	434321	434374	54	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	9 %	94502722
52	NC_007982	TAAGGA	4	434692	434721	30	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94502722
53	NC_007982	GATAAA	3	437361	437378	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	0 %	94502722
54	NC_007982	TTAGTA	3	440811	440829	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	94502722
55	NC_007982	TCTTTC	3	449346	449363	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	94502722
56	NC_007982	GGAACT	3	450229	450246	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	94502722
57	NC_007982	TCTGCT	3	451198	451214	17	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	94502722
58	NC_007982	GTTTTT	3	451596	451614	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	94502722
59	NC_007982	GGACAG	3	476076	476092	17	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	94502722
60	NC_007982	TCTCTG	3	481767	481783	17	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	94502722
61	NC_007982	TTACCA	3	482962	482978	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	94502722
62	NC_007982	TCATAG	3	487326	487342	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	94502722
63	NC_007982	ACAGGA	3	494842	494858	17	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	94502722
64	NC_007982	TAGGGT	7	501646	501687	42	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	7 %	94502722
65	NC_007982	TTCCTT	4	506259	506282	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	4 %	94502722
66	NC_007982	AAGCTA	3	518111	518129	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	94502722
67	NC_007982	CAGATA	3	521635	521652	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502722
68	NC_007982	TAGTAA	8	540926	540973	48	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	94502722
69	NC_007982	TTCTTT	3	547588	547606	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	94502722
70	NC_007982	TTGGCT	3	547791	547808	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	5 %	94502722
71	NC_007982	CTATCT	3	552484	552501	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
72	NC_007982	ATTCTG	3	566058	566075	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding

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