ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Perfect Repeats of Zea mays subsp. mays mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007982	ATAAGG	3	16556	16573	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007982	CTCTCG	3	18696	18713	18	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	94502579
3	NC_007982	ATGAGT	3	34566	34583	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007982	ATACGA	3	87036	87053	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94502719
5	NC_007982	ATAAGA	4	94794	94817	24	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502719
6	NC_007982	ATAGAA	3	99389	99406	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502719
7	NC_007982	TTAGAT	3	132492	132509	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94502719
8	NC_007982	GAATGG	3	182063	182080	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	94502722
9	NC_007982	TACTAG	3	265074	265091	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94502722
10	NC_007982	TCTTTA	3	265891	265908	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94502722
11	NC_007982	ACTTAG	3	276287	276304	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94502722
12	NC_007982	TATAGA	3	277179	277196	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94502722
13	NC_007982	AGTACT	3	284076	284093	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94502722
14	NC_007982	TATTAC	4	285759	285782	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94502722
15	NC_007982	ATGGAA	4	285784	285807	24	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94502722
16	NC_007982	GTACTA	3	296981	296998	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94502722
17	NC_007982	TTTCAC	3	305636	305653	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	94502722
18	NC_007982	CACTTA	3	316107	316124	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94502722
19	NC_007982	TAGCTT	3	363038	363055	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94502722
20	NC_007982	TTCTGG	3	373230	373247	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94502722
21	NC_007982	TTCCAT	3	388839	388856	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	94502722
22	NC_007982	ATGGCA	3	393985	394002	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94502722
23	NC_007982	ACCATA	5	397503	397532	30	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94502722
24	NC_007982	AAAGTA	3	409625	409642	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502722
25	NC_007982	TTATAG	3	425159	425176	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94502722
26	NC_007982	TATCTA	7	434321	434362	42	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94502722
27	NC_007982	TAAGGA	5	434692	434721	30	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94502722
28	NC_007982	GATAAA	3	437361	437378	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502722
29	NC_007982	TAGGGT	6	501646	501681	36	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	94502722
30	NC_007982	TTCCTT	3	506259	506276	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94502722
31	NC_007982	CAGATA	3	521635	521652	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94502722
32	NC_007982	TAGTAA	6	540933	540968	36	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94502722

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Perfect Repeats of Zea mays subsp. mays mitochondrion