ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Zea mays subsp. mays mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_007982AGC411186111971233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502560
2NC_007982ATA412410124211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %94502560
3NC_007982ATC512518125321533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %94502560
4NC_007982CTT41299613007120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502560
5NC_007982GAA413579135911366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
6NC_007982CTG41424114251110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
7NC_007982TAC415224152351233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
8NC_007982TTC41722717238120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
9NC_007982TAC521063210771533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
10NC_007982TAG521368213821533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %94502656
11NC_007982GAT422246222571233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502708
12NC_007982AAG424411244241466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
13NC_007982GAT427069270791133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502695
14NC_007982GTT42732927339110 %66.67 %33.33 %0 %9 %94502667
15NC_007982GTC42753727548120 %33.33 %33.33 %33.33 %0 %94502667
16NC_007982TCT43726137271110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
17NC_007982CTT44700247012110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
18NC_007982AGA448293483031166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
19NC_007982CTT44850448515120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
20NC_007982CGT45200652016110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %94502722
21NC_007982GAT452140521501133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502722
22NC_007982TTA453092531021133.33 %66.67 %0 %0 %9 %94502722
23NC_007982CTT45591855929120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
24NC_007982GTA457951579611133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502722
25NC_007982AGA459191592021266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
26NC_007982AAG469826698371266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502719
27NC_007982AGA471606716161166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502719
28NC_007982AGG472131721411133.33 %0 %66.67 %0 %9 %94502719
29NC_007982ACG474061740721233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502719
30NC_007982TCA478494785041133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %94502719
31NC_007982AAC482107821181266.67 %0 %0 %33.33 %8 %94502719
32NC_007982TGC58253082545160 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %94502719
33NC_007982GGT48331083322130 %33.33 %66.67 %0 %7 %94502719
34NC_007982ACT483693837041233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %94502719
35NC_007982TCC48393283942110 %33.33 %0 %66.67 %9 %94502719
36NC_007982ATG485386853961133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502719
37NC_007982ACA486181861931366.67 %0 %0 %33.33 %7 %94502719
38NC_007982AGT486944869551233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502719
39NC_007982GAG490021900311133.33 %0 %66.67 %0 %9 %94502719
40NC_007982CTT49438094390110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502719
41NC_007982CTT49579195802120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502719
42NC_007982GAC497197972081233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502719
43NC_007982AAG41022011022121266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502719
44NC_007982AAG41022571022691366.67 %0 %33.33 %0 %7 %94502719
45NC_007982CAA41033141033241166.67 %0 %0 %33.33 %9 %94502719
46NC_007982AGA41057221057331266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502719
47NC_007982CTA41057441057561333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %94502719
48NC_007982GAG41064681064781133.33 %0 %66.67 %0 %9 %94502719
49NC_007982TCT4113818113829120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502719
50NC_007982CTA41150581150681133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %94502719
51NC_007982TAT41156361156461133.33 %66.67 %0 %0 %9 %94502719
52NC_007982TCC4119022119033120 %33.33 %0 %66.67 %8 %94502719
53NC_007982ATA41199191199301266.67 %33.33 %0 %0 %8 %94502719
54NC_007982CAT41208711208811133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %94502719
55NC_007982GAC41210051210161233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502719
56NC_007982AGA41218711218811166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502719
57NC_007982TCT4124717124727110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502719
58NC_007982TCT4140346140357120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502719
59NC_007982ATT41438551438651133.33 %66.67 %0 %0 %9 %94502719
60NC_007982CTT4149641149652120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502719
61NC_007982CTT4152547152558120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502719
62NC_007982GCT4152832152843120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %94502719
63NC_007982AAG41539311539421266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502719
64NC_007982TCT4154965154977130 %66.67 %0 %33.33 %7 %94502719
65NC_007982CTT4155452155462110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502719
66NC_007982CTA51559971560111533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %94502719
67NC_007982AGT41563261563371233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502719
68NC_007982TCT4160395160406120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502719
69NC_007982ATA41627361627481366.67 %33.33 %0 %0 %7 %94502719
70NC_007982AAG41704461704571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
71NC_007982AGA41722261722361166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
72NC_007982AGG41727511727611133.33 %0 %66.67 %0 %9 %94502722
73NC_007982ACG41746811746921233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502722
74NC_007982CTT4176845176856120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
75NC_007982TAT41785581785691233.33 %66.67 %0 %0 %8 %94502722
76NC_007982GCA41786821786921133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %94502722
77NC_007982AAG41792691792801266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
78NC_007982ATT41854551854651133.33 %66.67 %0 %0 %9 %94502722
79NC_007982TCT4188246188256110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502722
80NC_007982GAA41895091895191166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
81NC_007982TAC41913861913961133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %94502722
82NC_007982AGC41937461937581333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %94502722
83NC_007982TTA41947661947771233.33 %66.67 %0 %0 %8 %94502722
84NC_007982AAG41961361961461166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
85NC_007982TCT4198582198593120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
86NC_007982TCT4204352204362110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502722
87NC_007982AGA42077822077941366.67 %0 %33.33 %0 %7 %94502722
88NC_007982ACA42089162089271266.67 %0 %0 %33.33 %0 %94502722
89NC_007982GAA42102012102111166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
90NC_007982TCT5211051211065150 %66.67 %0 %33.33 %6 %94502722
91NC_007982CTA42130732130841233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %94502722
92NC_007982CTG4213663213674120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %94502722
93NC_007982TTC4215081215093130 %66.67 %0 %33.33 %7 %94502722
94NC_007982GAA42152732152831166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
95NC_007982ACT42166702166821333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %94502722
96NC_007982CTA42179672179781233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %94502722
97NC_007982TAC42182492182591133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %94502722
98NC_007982ATT42245252245361233.33 %66.67 %0 %0 %8 %94502722
99NC_007982AAG42308332308441266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
100NC_007982ATT52331052331191533.33 %66.67 %0 %0 %6 %94502722
101NC_007982TCT4234575234585110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502722
102NC_007982TGT4236455236466120 %66.67 %33.33 %0 %8 %94502722
103NC_007982AGA52416422416551466.67 %0 %33.33 %0 %7 %94502722
104NC_007982CAG42438062438171233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502722
105NC_007982TGA42522672522781233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
106NC_007982CCA42539332539441233.33 %0 %0 %66.67 %8 %94502722
107NC_007982GAA42580482580591266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
108NC_007982CAG42582402582511233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502722
109NC_007982CTT4258883258893110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502722
110NC_007982GCC4263940263951120 %0 %33.33 %66.67 %8 %94502722
111NC_007982AAG42652092652201266.67 %0 %33.33 %0 %0 %94502722
112NC_007982ATC42666052666151133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %94502722
113NC_007982AGA42705122705231266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
114NC_007982AGA42722382722501366.67 %0 %33.33 %0 %7 %94502722
115NC_007982ACC42744782744901333.33 %0 %0 %66.67 %7 %94502722
116NC_007982CTC4277373277383110 %33.33 %0 %66.67 %9 %94502722
117NC_007982TCC4277672277683120 %33.33 %0 %66.67 %8 %94502722
118NC_007982AAG42821122821221166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
119NC_007982ACT42894272894371133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %94502722
120NC_007982CCT4289632289643120 %33.33 %0 %66.67 %8 %94502722
121NC_007982AAC42903612903721266.67 %0 %0 %33.33 %8 %94502722
122NC_007982AAG42908452908551166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
123NC_007982GAG42933412933511133.33 %0 %66.67 %0 %9 %94502722
124NC_007982GAA42955782955881166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
125NC_007982TAG43002243002341133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502722
126NC_007982ATG43005723005831233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
127NC_007982TCA53064673064801433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %94502722
128NC_007982GTA43078643078751233.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %94502722
129NC_007982TCT4311505311516120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
130NC_007982GTA53146563146691433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %94502722
131NC_007982ATT43180393180511333.33 %66.67 %0 %0 %7 %94502722
132NC_007982GAT43185233185331133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502722
133NC_007982GAT43216293216401233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
134NC_007982CTA43250453250561233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %94502722
135NC_007982GTA43316993317101233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
136NC_007982AGT53440493440621433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %94502722
137NC_007982TAG43457373457481233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
138NC_007982AAG43463593463691166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
139NC_007982AAT43468233468351366.67 %33.33 %0 %0 %7 %94502722
140NC_007982ATT43517793517891133.33 %66.67 %0 %0 %9 %94502722
141NC_007982AAG53527683527811466.67 %0 %33.33 %0 %7 %94502722
142NC_007982AGA43547753547851166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
143NC_007982CGA43592553592661233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502722
144NC_007982TAT43625433625551333.33 %66.67 %0 %0 %7 %94502722
145NC_007982TCT4363028363038110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502722
146NC_007982ATT43644963645061133.33 %66.67 %0 %0 %9 %94502722
147NC_007982GAA43667223667331266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
148NC_007982ACT43669543669651233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %94502722
149NC_007982ACT53675953676091533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %94502722
150NC_007982AGT43740073740171133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502722
151NC_007982GAA43741683741791266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
152NC_007982AGA53761063761211666.67 %0 %33.33 %0 %6 %94502722
153NC_007982CTA83786443786672433.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %94502722
154NC_007982ATA43791433791531166.67 %33.33 %0 %0 %9 %94502722
155NC_007982ATT53809003809141533.33 %66.67 %0 %0 %6 %94502722
156NC_007982AGA43834183834291266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
157NC_007982TTG4383452383464130 %66.67 %33.33 %0 %7 %94502722
158NC_007982AGA43866393866501266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
159NC_007982AGT43871633871731133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502722
160NC_007982TTG4389093389103110 %66.67 %33.33 %0 %9 %94502722
161NC_007982ATT43930863930971233.33 %66.67 %0 %0 %8 %94502722
162NC_007982GAG43938453938561233.33 %0 %66.67 %0 %8 %94502722
163NC_007982CTA43989153989271333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %94502722
164NC_007982TAG44055514055621233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
165NC_007982TTC4406241406251110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502722
166NC_007982GAA44066304066401166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
167NC_007982TTC4409066409078130 %66.67 %0 %33.33 %7 %94502722
168NC_007982GAT44117194117301233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
169NC_007982AGA44134474134571166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
170NC_007982TCT4413637413648120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
171NC_007982TCT4413674413685120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
172NC_007982TGT4413717413728120 %66.67 %33.33 %0 %8 %94502722
173NC_007982TCT4414360414372130 %66.67 %0 %33.33 %7 %94502722
174NC_007982TTA44176224176321133.33 %66.67 %0 %0 %9 %94502722
175NC_007982CGT4420169420180120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %94502722
176NC_007982GTT4420528420538110 %66.67 %33.33 %0 %9 %94502722
177NC_007982ATA44231214231311166.67 %33.33 %0 %0 %9 %94502722
178NC_007982AGT44263414263521233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
179NC_007982TCT4426972426983120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
180NC_007982AAT44272774272871166.67 %33.33 %0 %0 %9 %94502722
181NC_007982CTA44307594307711333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %94502722
182NC_007982TAG54332644332781533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %94502722
183NC_007982AGC44362214362321233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502722
184NC_007982CCT4438350438361120 %33.33 %0 %66.67 %8 %94502722
185NC_007982GAA44401944402061366.67 %0 %33.33 %0 %7 %94502722
186NC_007982CAA44413354413461266.67 %0 %0 %33.33 %8 %94502722
187NC_007982ACC44492424492531233.33 %0 %0 %66.67 %8 %94502722
188NC_007982GGA44511554511661233.33 %0 %66.67 %0 %8 %94502722
189NC_007982CAA44517894518001266.67 %0 %0 %33.33 %8 %94502722
190NC_007982TAA44582614582721266.67 %33.33 %0 %0 %8 %94502722
191NC_007982GAA44658234658331166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
192NC_007982CTT4466717466728120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
193NC_007982GAA44674464674571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
194NC_007982GTT4467458467469120 %66.67 %33.33 %0 %8 %94502722
195NC_007982GAA74675304675502166.67 %0 %33.33 %0 %4 %94502722
196NC_007982GAA44675564675671266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
197NC_007982GTG4471556471566110 %33.33 %66.67 %0 %9 %94502722
198NC_007982CTT4476461476472120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
199NC_007982TGC4481839481850120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %94502722
200NC_007982GAA44818974819081266.67 %0 %33.33 %0 %0 %94502722
201NC_007982CGT4482032482042110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %94502722
202NC_007982CTC4484968484979120 %33.33 %0 %66.67 %0 %94502722
203NC_007982ATT44882904883001133.33 %66.67 %0 %0 %9 %94502722
204NC_007982GTT4489395489406120 %66.67 %33.33 %0 %8 %94502722
205NC_007982CCT4491435491446120 %33.33 %0 %66.67 %8 %94502722
206NC_007982CCA44939174939281233.33 %0 %0 %66.67 %8 %94502722
207NC_007982TTG4497353497364120 %66.67 %33.33 %0 %8 %94502722
208NC_007982GAA45000265000381366.67 %0 %33.33 %0 %7 %94502722
209NC_007982TAA45006835006941266.67 %33.33 %0 %0 %8 %94502722
210NC_007982TAA55018705018841566.67 %33.33 %0 %0 %6 %94502722
211NC_007982CAG45045435045531133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %94502722
212NC_007982ACC45046455046561233.33 %0 %0 %66.67 %0 %94502722
213NC_007982TGC4511077511088120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %94502722
214NC_007982CTT4511397511408120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
215NC_007982ACG45124205124311233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502722
216NC_007982TCT4513296513306110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502722
217NC_007982TGA45176395176501233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
218NC_007982CTT4518288518299120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
219NC_007982TAA45271985272091266.67 %33.33 %0 %0 %8 %94502722
220NC_007982GAA45347605347701166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502722
221NC_007982CTT4535654535665120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502722
222NC_007982GAA45363835363941266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
223NC_007982GTT4536395536406120 %66.67 %33.33 %0 %8 %94502722
224NC_007982GAA75364675364872166.67 %0 %33.33 %0 %4 %94502722
225NC_007982GAA45364935365041266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
226NC_007982ATT45380985381101333.33 %66.67 %0 %0 %7 %94502722
227NC_007982CTT4538956538967120 %66.67 %0 %33.33 %0 %94502722
228NC_007982ATG45402605402701133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502722
229NC_007982TAG45457845457951233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502722
230NC_007982GAA45466615466721266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502722
231NC_007982TAG45469645469741133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502722
232NC_007982ACT55485245485371433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %94502722
233NC_007982ATA65501965502141966.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
234NC_007982TAT55502265502391433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
235NC_007982TGT4551601551612120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
236NC_007982TCT4552890552901120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
237NC_007982TCT4553879553889110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
238NC_007982AGA45570385570491266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
239NC_007982AGT45600945601051233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
240NC_007982ATG45627265627371233.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %94502577
241NC_007982GTT4563275563286120 %66.67 %33.33 %0 %8 %94502577