ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Zea mays subsp. mays mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007982	CTCTA	4	4498	4517	20	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007982	ATTTC	3	5247	5261	15	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007982	ACGAG	3	5390	5404	15	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007982	ATC	4	12521	12532	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94502560
5	NC_007982	ATAAGG	3	16556	16573	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007982	CTCTCG	3	18696	18713	18	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	94502579
7	NC_007982	TAC	4	21063	21074	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007982	TATAG	3	21252	21266	15	40 %	40 %	20 %	0 %	94502656
9	NC_007982	TAG	4	21368	21379	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94502656
10	NC_007982	TCATA	6	26676	26705	30	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007982	GTC	4	27537	27548	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94502667
12	NC_007982	CT	6	28064	28075	12	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007982	TAGC	3	31390	31401	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007982	ATGAGT	3	34566	34583	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007982	GGAT	3	43029	43040	12	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007982	CTACA	3	51240	51254	15	40 %	20 %	0 %	40 %	94502722
17	NC_007982	AAAG	3	53428	53439	12	75 %	0 %	25 %	0 %	94502722
18	NC_007982	CTGA	3	65683	65694	12	25 %	25 %	25 %	25 %	94502719
19	NC_007982	TAATA	3	69469	69483	15	60 %	40 %	0 %	0 %	94502719
20	NC_007982	AAAGT	3	70113	70127	15	60 %	20 %	20 %	0 %	94502719
21	NC_007982	GCTA	3	80112	80123	12	25 %	25 %	25 %	25 %	94502719
22	NC_007982	ATAGT	5	86785	86809	25	40 %	40 %	20 %	0 %	94502719
23	NC_007982	ATACGA	3	87036	87053	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94502719
24	NC_007982	TA	6	92602	92613	12	50 %	50 %	0 %	0 %	94502719
25	NC_007982	TAAGA	4	93302	93321	20	60 %	20 %	20 %	0 %	94502719
26	NC_007982	ATAAGA	4	94794	94817	24	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502719
27	NC_007982	CTTT	3	95124	95135	12	0 %	75 %	0 %	25 %	94502719
28	NC_007982	ATAGAA	3	99389	99406	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502719
29	NC_007982	CTTAA	3	102809	102823	15	40 %	40 %	0 %	20 %	94502719
30	NC_007982	GCTC	3	109787	109798	12	0 %	25 %	25 %	50 %	94502719
31	NC_007982	CT	6	112502	112513	12	0 %	50 %	0 %	50 %	94502719
32	NC_007982	AAAAG	3	113329	113343	15	80 %	0 %	20 %	0 %	94502719
33	NC_007982	CTTT	3	119581	119592	12	0 %	75 %	0 %	25 %	94502719
34	NC_007982	TGTAG	3	121766	121780	15	20 %	40 %	40 %	0 %	94502719
35	NC_007982	CATC	3	129979	129990	12	25 %	25 %	0 %	50 %	94502719
36	NC_007982	TTAGAT	3	132492	132509	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94502719
37	NC_007982	CTATA	3	132816	132830	15	40 %	40 %	0 %	20 %	94502719
38	NC_007982	ATAGT	3	132956	132970	15	40 %	40 %	20 %	0 %	94502719
39	NC_007982	GATT	3	138337	138348	12	25 %	50 %	25 %	0 %	94502719
40	NC_007982	TTTGC	3	146874	146888	15	0 %	60 %	20 %	20 %	94502719
41	NC_007982	AATG	3	162603	162614	12	50 %	25 %	25 %	0 %	94502719
42	NC_007982	CTGA	3	166303	166314	12	25 %	25 %	25 %	25 %	94502722
43	NC_007982	TAATA	3	170089	170103	15	60 %	40 %	0 %	0 %	94502722
44	NC_007982	AAAGT	3	170733	170747	15	60 %	20 %	20 %	0 %	94502722
45	NC_007982	GAATGG	3	182063	182080	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	94502722
46	NC_007982	TAAG	3	183647	183658	12	50 %	25 %	25 %	0 %	94502722
47	NC_007982	TCTT	3	185570	185581	12	0 %	75 %	0 %	25 %	94502722
48	NC_007982	TATT	3	185781	185792	12	25 %	75 %	0 %	0 %	94502722
49	NC_007982	TAAGT	5	188773	188797	25	40 %	40 %	20 %	0 %	94502722
50	NC_007982	GACT	3	196294	196305	12	25 %	25 %	25 %	25 %	94502722
51	NC_007982	TTTAG	5	204120	204144	25	20 %	60 %	20 %	0 %	94502722
52	NC_007982	GAAA	3	207749	207760	12	75 %	0 %	25 %	0 %	94502722
53	NC_007982	ACA	4	208916	208927	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94502722
54	NC_007982	TCT	4	211051	211062	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94502722
55	NC_007982	GCAA	3	216738	216749	12	50 %	0 %	25 %	25 %	94502722
56	NC_007982	CTTA	3	220727	220738	12	25 %	50 %	0 %	25 %	94502722
57	NC_007982	TCCTG	3	226729	226743	15	0 %	40 %	20 %	40 %	94502722
58	NC_007982	TATAT	4	231945	231964	20	40 %	60 %	0 %	0 %	94502722
59	NC_007982	ATT	4	233105	233116	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94502722
60	NC_007982	ATCAA	3	235669	235683	15	60 %	20 %	0 %	20 %	94502722
61	NC_007982	AGA	4	241642	241653	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94502722
62	NC_007982	CAGT	3	243742	243753	12	25 %	25 %	25 %	25 %	94502722
63	NC_007982	CTGT	3	244576	244587	12	0 %	50 %	25 %	25 %	94502722
64	NC_007982	TTAGT	3	245050	245064	15	20 %	60 %	20 %	0 %	94502722
65	NC_007982	CTCTA	4	248008	248027	20	20 %	40 %	0 %	40 %	94502722
66	NC_007982	ATTTC	3	248757	248771	15	20 %	60 %	0 %	20 %	94502722
67	NC_007982	ACGAG	3	248900	248914	15	40 %	0 %	40 %	20 %	94502722
68	NC_007982	TGGC	3	251469	251480	12	0 %	25 %	50 %	25 %	94502722
69	NC_007982	CAAT	3	259926	259937	12	50 %	25 %	0 %	25 %	94502722
70	NC_007982	CCAAT	3	259938	259952	15	40 %	20 %	0 %	40 %	94502722
71	NC_007982	TACTAG	3	265074	265091	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94502722
72	NC_007982	AAG	4	265209	265220	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94502722
73	NC_007982	TCTTTA	3	265891	265908	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94502722
74	NC_007982	TGGAT	3	271247	271261	15	20 %	40 %	40 %	0 %	94502722
75	NC_007982	ACTTAG	3	276287	276304	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94502722
76	NC_007982	TATAGA	3	277179	277196	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94502722
77	NC_007982	ACTTT	3	278892	278906	15	20 %	60 %	0 %	20 %	94502722
78	NC_007982	GAAA	3	279197	279208	12	75 %	0 %	25 %	0 %	94502722
79	NC_007982	TTGC	3	282126	282137	12	0 %	50 %	25 %	25 %	94502722
80	NC_007982	AGTACT	3	284076	284093	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94502722
81	NC_007982	TATTAC	4	285759	285782	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94502722
82	NC_007982	ATGGAA	4	285784	285807	24	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94502722
83	NC_007982	GTGA	3	288579	288590	12	25 %	25 %	50 %	0 %	94502722
84	NC_007982	GTACTA	3	296981	296998	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94502722
85	NC_007982	AATTC	3	297537	297551	15	40 %	40 %	0 %	20 %	94502722
86	NC_007982	GATA	3	298992	299003	12	50 %	25 %	25 %	0 %	94502722
87	NC_007982	AGTAT	3	299529	299543	15	40 %	40 %	20 %	0 %	94502722
88	NC_007982	ATCAT	3	299765	299779	15	40 %	40 %	0 %	20 %	94502722
89	NC_007982	TTTCAC	3	305636	305653	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	94502722
90	NC_007982	GTA	4	307864	307875	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94502722
91	NC_007982	GGGCC	3	312368	312382	15	0 %	0 %	60 %	40 %	94502722
92	NC_007982	ATAA	3	314123	314134	12	75 %	25 %	0 %	0 %	94502722
93	NC_007982	GCAA	3	316082	316093	12	50 %	0 %	25 %	25 %	94502722
94	NC_007982	CACTTA	3	316107	316124	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94502722
95	NC_007982	ATCCT	4	316406	316425	20	20 %	40 %	0 %	40 %	94502722
96	NC_007982	CGGC	3	323062	323073	12	0 %	0 %	50 %	50 %	94502722
97	NC_007982	TCTAT	3	336878	336892	15	20 %	60 %	0 %	20 %	94502722
98	NC_007982	TATAG	4	341121	341140	20	40 %	40 %	20 %	0 %	94502722
99	NC_007982	CCTGG	3	341852	341866	15	0 %	20 %	40 %	40 %	94502722
100	NC_007982	TAAA	3	343390	343401	12	75 %	25 %	0 %	0 %	94502722
101	NC_007982	AGT	4	344051	344062	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94502722
102	NC_007982	ATAGT	4	352540	352559	20	40 %	40 %	20 %	0 %	94502722
103	NC_007982	GCCT	3	354812	354823	12	0 %	25 %	25 %	50 %	94502722
104	NC_007982	ATTCC	3	356797	356811	15	20 %	40 %	0 %	40 %	94502722
105	NC_007982	TAGCTT	3	363038	363055	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94502722
106	NC_007982	ACT	4	367595	367606	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94502722
107	NC_007982	TA	6	370397	370408	12	50 %	50 %	0 %	0 %	94502722
108	NC_007982	TATAG	3	371870	371884	15	40 %	40 %	20 %	0 %	94502722
109	NC_007982	GTAAA	6	372875	372904	30	60 %	20 %	20 %	0 %	94502722
110	NC_007982	TTCTGG	3	373230	373247	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94502722
111	NC_007982	AGAA	3	374462	374473	12	75 %	0 %	25 %	0 %	94502722
112	NC_007982	CTCCA	3	376390	376404	15	20 %	20 %	0 %	60 %	94502722
113	NC_007982	CTA	6	378647	378664	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94502722
114	NC_007982	TTTG	3	380236	380247	12	0 %	75 %	25 %	0 %	94502722
115	NC_007982	TTTC	3	380350	380361	12	0 %	75 %	0 %	25 %	94502722
116	NC_007982	ATT	4	380903	380914	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94502722
117	NC_007982	TTAGT	4	381977	381996	20	20 %	60 %	20 %	0 %	94502722
118	NC_007982	ATAGT	5	381997	382021	25	40 %	40 %	20 %	0 %	94502722
119	NC_007982	TCCT	3	382540	382551	12	0 %	50 %	0 %	50 %	94502722
120	NC_007982	ATAGG	8	384202	384241	40	40 %	20 %	40 %	0 %	94502722
121	NC_007982	AG	6	384593	384604	12	50 %	0 %	50 %	0 %	94502722
122	NC_007982	TATAG	7	388358	388392	35	40 %	40 %	20 %	0 %	94502722
123	NC_007982	TTCCAT	3	388839	388856	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	94502722
124	NC_007982	TCTT	3	390114	390125	12	0 %	75 %	0 %	25 %	94502722
125	NC_007982	ATGGG	3	392184	392198	15	20 %	20 %	60 %	0 %	94502722
126	NC_007982	ATGGCA	3	393985	394002	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94502722
127	NC_007982	ACCATA	5	397503	397532	30	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94502722
128	NC_007982	GTTAG	3	402112	402126	15	20 %	40 %	40 %	0 %	94502722
129	NC_007982	GTAAA	3	409328	409342	15	60 %	20 %	20 %	0 %	94502722
130	NC_007982	AAAGTA	3	409625	409642	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94502722
131	NC_007982	CAAG	3	410558	410569	12	50 %	0 %	25 %	25 %	94502722
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192	NC_007982	TGAG	3	531852	531863	12	25 %	25 %	50 %	0 %	94502722
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202	NC_007982	ACTAA	3	550525	550539	15	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
203	NC_007982	CTATA	3	551512	551526	15	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
204	NC_007982	ATG	4	562726	562737	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94502577
205	NC_007982	T	12	566192	566203	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Zea mays subsp. mays mitochondrion