ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Homalodisca vitripennis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006899	ATGA	3	1	12	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	62161310
2	NC_006899	TTA	4	580	591	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	62161310
3	NC_006899	TAATTA	3	1685	1702	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	62161311
4	NC_006899	TAA	4	2758	2769	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	62161313
5	NC_006899	TATTT	3	2777	2792	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	62161313
6	NC_006899	ATTT	3	2839	2849	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	62161313
7	NC_006899	ATT	4	3844	3855	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	62161314
8	NC_006899	TTG	4	3938	3949	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	62161314
9	NC_006899	T	14	4072	4085	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	62161315
10	NC_006899	ATT	4	4119	4130	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	62161315
11	NC_006899	ATC	4	4266	4277	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	62161315
12	NC_006899	TAA	4	5033	5043	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	62161316
13	NC_006899	TA	6	5214	5225	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	62161316
14	NC_006899	TTA	4	5257	5268	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	62161316
15	NC_006899	AAT	4	5276	5286	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	62161316
16	NC_006899	AAAT	3	5323	5333	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	62161316
17	NC_006899	AATA	3	5912	5922	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	62161316
18	NC_006899	TAAA	3	6070	6081	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	62161316
19	NC_006899	AAAAT	3	6412	6425	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	62161316
20	NC_006899	TAAA	3	6656	6667	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	62161317
21	NC_006899	TAA	4	7380	7391	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	62161317
22	NC_006899	A	12	7503	7514	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	62161317
23	NC_006899	TAAT	3	7556	7566	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	62161317
24	NC_006899	TAAA	3	7752	7763	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	62161317
25	NC_006899	A	14	7810	7823	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	62161317
26	NC_006899	TATAAA	3	7934	7950	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	62161318
27	NC_006899	AAAT	3	8099	8109	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	62161318
28	NC_006899	TA	6	8439	8449	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	62161319
29	NC_006899	TAT	5	8508	8522	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	62161319
30	NC_006899	AAAT	3	8531	8541	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	62161319
31	NC_006899	TCAA	3	8599	8609	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	62161319
32	NC_006899	AATC	3	8624	8634	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	62161319
33	NC_006899	TAT	4	8875	8885	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	62161320
34	NC_006899	TTA	4	9087	9097	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	62161320
35	NC_006899	TAT	4	9292	9303	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	62161320
36	NC_006899	GAAC	3	10052	10062	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	62161321
37	NC_006899	ATAAA	3	10096	10110	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	62161321
38	NC_006899	AATT	3	10648	10659	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	62161321
39	NC_006899	TAAAT	4	11196	11214	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
40	NC_006899	TAAA	3	11219	11230	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_006899	TAAAA	3	11387	11400	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_006899	TAA	6	12008	12025	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_006899	TAAAA	3	12066	12080	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_006899	AAAATA	3	12928	12946	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
45	NC_006899	TTAA	3	13143	13153	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_006899	AAT	4	13225	13236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_006899	TA	6	13329	13339	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_006899	TA	9	13385	13401	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_006899	AT	6	13412	13422	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_006899	TTA	4	13425	13437	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_006899	TA	6	13450	13460	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_006899	TA	9	13506	13522	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_006899	AT	6	13533	13543	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_006899	TTA	4	13546	13558	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_006899	TA	6	13571	13581	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_006899	TA	9	13627	13643	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_006899	AT	6	13654	13664	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_006899	TTA	4	13667	13679	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_006899	TA	6	13692	13702	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_006899	ATT	5	13856	13870	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_006899	ATT	4	14379	14389	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	62161322
62	NC_006899	TAG	4	14465	14476	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	62161322
63	NC_006899	TTA	4	14501	14511	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	62161322
64	NC_006899	ATT	4	14788	14799	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	62161322
65	NC_006899	ATT	4	15055	15066	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	62161322

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Homalodisca vitripennis mitochondrion