ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Habronattus oregonensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005942	GTTT	3	73	83	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	49146950
2	NC_005942	ATT	4	471	482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146950
3	NC_005942	TTAT	3	849	860	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49146950
4	NC_005942	TAT	4	1457	1469	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	49146949
5	NC_005942	AAT	5	2750	2764	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	49146948
6	NC_005942	TGA	4	3038	3048	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	49146948
7	NC_005942	TTTA	3	3797	3808	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49146946
8	NC_005942	T	16	4371	4386	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	49146945
9	NC_005942	TTA	4	5107	5118	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146944
10	NC_005942	TATT	3	5125	5135	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	49146944
11	NC_005942	AG	6	5169	5180	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	49146944
12	NC_005942	ATTAG	3	5397	5410	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	49146944
13	NC_005942	TAT	4	6769	6780	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146943
14	NC_005942	AAT	4	7644	7655	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49146942
15	NC_005942	AAT	4	7701	7712	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49146942
16	NC_005942	TAT	4	7743	7754	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146942
17	NC_005942	TAAA	3	7853	7863	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	49146942
18	NC_005942	ATT	4	8365	8376	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146942
19	NC_005942	GTAA	3	8458	8468	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	49146942
20	NC_005942	ATT	4	8659	8670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146942
21	NC_005942	ATA	5	8728	8743	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	49146942
22	NC_005942	GAT	4	8933	8944	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	49146941
23	NC_005942	TAA	4	9069	9080	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49146941
24	NC_005942	TAT	4	9220	9230	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49146940
25	NC_005942	TAT	4	9979	9991	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	49146939
26	NC_005942	TTTTA	3	10325	10338	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	49146939
27	NC_005942	ATT	4	10612	10624	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	49146939
28	NC_005942	AT	6	10658	10669	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49146939
29	NC_005942	AT	9	10868	10884	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	49146938
30	NC_005942	AT	6	10948	10958	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49146938
31	NC_005942	AGAA	3	11334	11345	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	49146938
32	NC_005942	AATT	3	11824	11835	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_005942	TAGA	3	11877	11887	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_005942	AATT	3	12063	12074	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_005942	CAGT	3	12372	12383	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_005942	TAT	4	12605	12615	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_005942	TAT	4	12647	12658	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_005942	TTAA	3	12760	12771	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_005942	TTAA	3	13338	13350	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_005942	TA	7	13814	13826	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_005942	AGAA	3	14076	14086	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_005942	ATTT	3	14270	14281	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Habronattus oregonensis mitochondrion