ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ixodes holocyclus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005293	ATT	4	47	58	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_005293	TAT	4	108	120	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39656301
3	NC_005293	TAT	4	322	333	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656301
4	NC_005293	ATT	6	482	499	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39656301
5	NC_005293	TTTAT	3	630	644	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	39656301
6	NC_005293	CTTT	3	759	771	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	39656301
7	NC_005293	T	12	976	987	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	39656301
8	NC_005293	TTAA	3	1176	1187	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_005293	TCT	4	1541	1552	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39656302
10	NC_005293	CTT	4	1797	1809	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	39656302
11	NC_005293	TTA	4	2844	2855	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656303
12	NC_005293	ATT	4	3791	3802	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	39656305
13	NC_005293	ATT	4	3941	3951	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39656305
14	NC_005293	ATT	4	4458	4469	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656306
15	NC_005293	T	15	4645	4659	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	39656306
16	NC_005293	ATT	4	5120	5131	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656306
17	NC_005293	ATT	4	5233	5244	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656307
18	NC_005293	ATT	4	5488	5498	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39656307
19	NC_005293	ATA	4	5943	5954	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39656308
20	NC_005293	TTAT	3	6100	6111	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39656308
21	NC_005293	A	15	6880	6894	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	39656308
22	NC_005293	TA	6	7099	7109	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39656308
23	NC_005293	AAT	4	7277	7288	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39656308
24	NC_005293	TAT	4	7357	7368	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656308
25	NC_005293	ATA	4	7429	7440	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39656308
26	NC_005293	ATT	4	7637	7648	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_005293	TA	6	7804	7815	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39656309
28	NC_005293	TA	6	8285	8295	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39656309
29	NC_005293	TAA	4	8524	8536	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39656309
30	NC_005293	A	15	8648	8662	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	39656309
31	NC_005293	TAT	4	8768	8779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656309
32	NC_005293	A	23	8876	8898	23	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	39656309
33	NC_005293	TA	7	9226	9238	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39656310
34	NC_005293	ATT	4	9463	9474	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656311
35	NC_005293	A	12	9622	9633	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	39656311
36	NC_005293	TTA	4	9634	9645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656311
37	NC_005293	TTTAAT	3	9654	9672	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39656311
38	NC_005293	TAA	4	9785	9796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39656311
39	NC_005293	TTAT	3	10079	10089	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39656312
40	NC_005293	T	12	10132	10143	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	39656312
41	NC_005293	ATT	4	10712	10723	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656312
42	NC_005293	ACTTT	3	10877	10891	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	39656312
43	NC_005293	TAT	4	11087	11098	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39656313
44	NC_005293	TATCGA	3	11101	11117	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	39656313
45	NC_005293	ATAA	3	11193	11204	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39656313
46	NC_005293	AACTA	3	11206	11219	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	39656313
47	NC_005293	AAAT	3	11368	11378	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39656313
48	NC_005293	TTAA	3	12786	12797	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_005293	TTAA	3	13605	13616	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ixodes holocyclus mitochondrion